美国《Emerging Infectious Diseases》2014年第1期有关人兽共患病论文摘译

P132010年巴基斯坦与洪水相关的O1群霍乱弧菌的基因组流行病学//MuhammadAliShah,AnkurMutreja,NicholasThomson等

2010年8月，巴基斯坦遭遇了大洪水及随后的霍乱流行。为了明确巴基斯坦霍乱弧菌的菌群动态和传播方式，我们将所有O1群埃尔托型霍乱弧菌分离株进行基因组测序，并与来自全球的146株霍乱弧菌基因组进行比较。在全球的系统发育树中，所有巴基斯坦分离株形成了2个新的进化枝(PSC-1 和 PSC-2)，它们位于第七次大流行传播的第三波谱系，并能通过基因标志缺失和对抗菌药物敏感性辨别。地理方面，PSC-1分离株来自沿海，而PSC-2分离株来自被印度河淹没的内陆地区。单核苷酸多态性聚类分析显示，PSC-2的传播同河道流向有关。我们发现2010年巴基斯坦霍乱流行至少有2个源头，揭示了在研究霍乱暴发时全球基因组数据库的价值。

P21始祖菌肯尼迪分枝杆菌克隆在吉布提引起淋巴结结核流行//YannBlouin,GéraldineCazajous,CélineDehan等

存在于未知环境或储存宿主的肯尼迪分枝杆菌(Mycobacteriumcanettii)是一种人类机会致病菌，是结核分枝杆菌的始祖菌。自1969年该菌被发现以来，已知约70株肯尼迪分枝杆菌分离株都来自吉布提共和国，且常分离自移居国外的儿童和成人。全基因组测序发现，大多数于2010年2月至2013年3月期间收集的、并与2次儿童淋巴结结核暴发流行相关的菌株，都属于同一个独特的肯尼迪分枝杆菌流行性克隆。1983年以来该克隆不断发生演变，这种演变可以模拟结核分枝杆菌的起源。因此，认识这种微生物并确定它的储存宿主在临床上具有重要性。

P29轮状病毒疫苗接种的成本-效益动态模型分析//BirgitteFreieslebendeBlasio,ElmiraFlem,RenatLatipov等

哈萨克斯坦是中亚的一个中等收入国家，政府正在考虑将轮状病毒疫苗纳入国家计划免疫项目。我们通过使用综合动态传播模型计算群体保护率，进行跨越20年轮状病毒疫苗接种成本-效益分析。结果显示90%的免疫接种覆盖率在5岁以下儿童群体减少大约880例轮状病毒死亡，平均挽救了54 784生命年。间接保护可分别减少40%重症及60%轻微的轮状病毒胃肠炎。每个生命年可节省来自社会方面的费用18 044美元及来自卫生保健方面的费用23 892美元。对照成本-效益的两个主要参数，死亡率和小于2.78美元的每剂疫苗成本,计划免疫成本应该被完全抵消。为了进一步评价计划免疫项目的效益，由接种疫苗赋予的间接保护作用值得进一步研究。

P382001-2010年美国明尼苏达州散发性肠道感染病人食用生奶的情况//TrishaJ.Robinson,JoniM.Scheftel,andKirkE.Smith

生奶多次被确定为食源性疾病爆发的原因，然而，作为已记录在册的爆发病例，其数量仅占实际生奶相关疾病病例的一小部分。常规监测数据分析表明，2001—2010年间明尼苏达州报告的散发及国内感染的肠道感染病例中有3.7%在暴露期间有食用生奶。孩子们受影响的比例更大，在这类疾病中，76%的5岁以下儿童食用了来自于自家或亲戚农场的生奶。21%的O157大肠杆菌感染病例报告食用生奶，其中的重症病例包括溶血性尿毒症，尚有1例死亡。生奶的食用者与潜在的食用者、以及那些认为可放松生奶销售管控的政策制定者，应当接受教育，了解食用生奶与疾病的关系。

P45多方验证隐球菌抗原侧向层析试验以及激光热对比定量试验//DavidR.Boulware,MelissaA.Rolfes,RadhaRajasingham等

在撒哈拉沙漠以南非洲地区隐球菌脑膜炎是一种常见疾病。为评价快速、即时的隐球菌抗原(CRAG)侧向免疫层析试验(LFA)，我们对832例疑似脑膜炎的HIV感染者(其中299例来自2006-2009年乌干达，533例来自2010—2012乌干达和南非)进行了脑脊液(CSF)培养、CRAG乳胶凝集试验、墨汁涂片显微镜检以及CRAG LFA，并评估其诊断效能。CRAG LFA其诊断效能最好(敏感性为99.3%,特异性为99.1%)，CSF培养的敏感性依赖于CSF量(10 μL为82.4%，100 μL为94.2%)，CRAG乳胶凝集试验敏感性(97.0%～97.8%)和特异性(85.9%～100%)因生产商而异。墨汁涂片显微镜检敏感性为86%。激光热对比定量试验测量免疫层析条带中的CRAG浓度有92%的准确性(R=0.91,P<0.001)。在资源有限的条件下，CRAG LFA对脑膜炎诊断是一种很大的进步。

P54孟加拉国2010-2011年霍乱暴发期间霍乱弧菌的遗传变异//ShahM.Rashed,AndrewS.Azman,MunirulAlam等

霍乱仍是一个主要的公共卫生问题。为了比较外环境菌株和病人菌株在暴发中所起的不同作用，我们在孟加拉国2个不同的地理区域收集了2010—2011年霍乱暴发期间的标本，对其进行多位点可变数目串联重复序列分析。我们系统地收集了222株来自Chhatak和Mathbaria外环境及临床的O1群霍乱弧菌菌株。Chhatak的79株菌株中有75株来自同一克隆复合群，该复合群在单一基因位点随时间发生连续广泛的突变。共有59株分离自6位患者，大多数来自同一患者的分离株出现连续的单位点突变。Mathbaria的84株菌株中有60株形成2个独立的克隆复合群。与来自环境的菌株相比，来自患者的菌株形成的遗传谱系数量较少，这与疾病暴发期间某些菌株在人间加速传播的现象相吻合。