染色体12p13上的rs12425791多态性与缺血性脑卒中患者血脂的相关性

2014-09-13 01:36宋旭津谢娟娟
中国老年学杂志 2014年23期
关键词:等位基因分型多态性

古 联 宋旭津 谢娟娟 陈 清 严 雁 苏 莉

(广西中医药大学第一附属医院,广西 南宁 530023)

脑卒中是一种严重致残和致死的常见神经系统疾病,且约85%~90%的脑卒中为缺血性脑卒中(IS)〔1〕。近年一项全基因组关联研究(GWAS)〔2〕发现高加索人染色体12p13上NINJ2基因附近的rs12425791多态性与IS之间的关联达到了全基因组关联显著性水准,因此,rs12425791被认为是很有可能的IS的易感遗传变异。本研究分析IS患者rs12425791多态性与血脂水平的相关性。

1 对象与方法

1.1研究对象 2009年7月至2011年6月在广西中医药大学第一附属医院神经内科住院治疗的IS患者,每名患者均经2名主治医师以上职称的神经内科医师,根据1995年中华医学会第四次全国脑血管病学术会议《各类脑血管疾病诊断要点》〔3〕进行诊断,且所有患者均经CT和(或)MRI检查确诊为IS。共纳入166例IS患者,男104例,女62例,平均年龄(68.23±8.46)岁。采用自行设计的统一调查问卷,对病例或其家属进行询问,内容包括研究对象的一般情况、高血压病史和糖尿病病史等既往病史以及吸烟、饮酒等行为生活方式状况。166例病例均自我报告为广西汉族人,并知情同意,而且所有病例之间均无亲缘关系。

1.2标本采集及血脂检测 患者住院次日清晨空腹抽取外周血液标本5 ml,分为抗凝血和非抗凝血。将抗凝血置于-4℃保存,于3 d内提取血液基因组DNA。非抗凝管血用于进行血脂检测,采用日立 7600全自动生化分析仪检测总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)。血脂异常:根据中国成人血脂异常诊断标准〔3〕,TC≥6.22 mmol/L为升高,TG≥2.26 mmol/L为升高,LDL-C≥4.14 mmol/L为升高,HDL-C<1.04 mmol/L为降低。

1.3DNA提取及基因分型 本研究采用天根科技(北京)有限公司生产的血液基因组DNA提取试剂盒〔TIANamp Blood DNA Kit(离心柱形),目录号DP318DNA〕,按照产品说明书所述步骤提取血液基因组DNA。将提取后的DNA分装为3管,于-20℃保存以备用。使用美国应用生物系统(ABI) 公司生产的ABI7500 Fast 实时荧光定量PCR仪以及TaqMan SNP基因分型试剂盒〔试剂盒包括2×通用PCR预混试剂Universal PCR Master mix (无AmpErase UNG酶),40×SNP 基因分型试剂Genotyping Assay Mix〕,采用TaqMan MGB探针等位基因分型技术来对rs12425791进行基因分型。PCR反应体系的总体积为10 μl,包含:2×TaqMan Universal PCR Mix,5.00 μl;Assay-on-Demand SNP Genotyping Assay Mix(40×),0.25 μl;无核酸H2O,3.75 μl;基因组DNA,1.00 μl。PCR的反应条件:预变性95℃10 min,变性92℃ 15 s、退火60℃ 1 min,变性以及退火程序循环43次。对基因分型实验操作采取以下措施进行质量控制:对实验的操作者施盲,使其在进行基因分型时不知道标本的病例/对照状态;每次96孔PCR反应板均要设置2个空白对照并设置3个随机重复样本作为阳性对照;而且,随机抽取5%的检测样本做盲法重复测定,检测结果一致率达100%。

1.4统计学方法 采用SPSS16.0软件进行χ2及t检验。

2 结 果

2.1HarDY-Weinberg Equilibrium(HWE)检验 rs12425791基因型在166例IS患者中的频数观察值分别为103,54,9;期望值分别为102,56,8。频数观察值和期望值差异无显著性(χ2=0.297,P=0.586),符合HarDY-Weinberg平衡定律(P>0.05),说明本研究应用的抽样群体适合于遗传分析。

2.2不同rs12425791基因型IS患者的血脂水平比较 由于G/G基因型患者例数较少,为便于比较,将G/G基因型与A/A基因型患者合并为(G/A+A/A)基因型组。不同rs12425791基因型IS患者的血脂水平相比较,G/G基因型患者与(G/A+A/A)基因型患者在TC、TG、LDL、HDL水平上的差异均无统计学意义(P>0.05);不同rs12425791等位基因IS患者的血脂水平相比较,G等位基因患者与A等位基因患者在TC、TG、LDL、HDL水平上的差异也均无统计学意义(P>0.05)。见表1。

2.3不同rs12425791等位基因型IS患者血脂比较 不同rs12425791基因型IS患者的血脂异常率比较,G/G基因型患者与(G/A+A/A)基因型患者在TC、TG、LDL、HDL异常率上的差异均无统计学意义(P>0.05);不同rs12425791等位基因IS患者的血脂异常率相比较,G等位基因患者与A等位基因患者在TC、TG、LDL、HDL异常率上的差异也均无统计学意义(P>0.05)。见表2。

表1 不同rs12425791基因型、等位基因IS患者血脂比较

表2 不同rs12425791基因型、等位基因IS患者血脂异常比较〔n(%)〕

3 讨 论

rs12425791是Ikram等〔2〕的GWAS所发现与IS的关联性达到GWAS显著性水准的SNP。rs12425791是邻近NINJ2基因一个位点。NINJ2基因编码ninjurin2蛋白,ninjurin2是一种嗜同种的与基质金属蛋白酶相互作用的细胞-细胞黏附分子〔4〕,在人类骨髓、外周白细胞、肺和淋巴结中高表达。目前,NINJ2基因对IS的功能作用在很大程度上仍是不清楚的。

据报道,IS可控制的危险因素主要包括高血压、糖尿病、高脂血症等,而年龄、性别及种族则是不可控制的危险因素。高脂血症〔5〕可能是一种致炎状态,当发生局灶性循环障碍时可以介导免疫炎症反应而加重组织损伤,而调脂治疗能改善脑血管病患者的预后〔6〕。既往国内外有关易感基因遗传多态性与IS患者血脂代谢的相关性研究结果并不一致:例如,有研究报道APOE基因与脑梗死血脂异常相关联〔7,8〕,还有研究报道CD14基因多态性可能通过影响血脂水平而影响IS的发生〔9〕。但是,也有文献报道易感基因遗传多态性与IS血脂水平无关联,例如,Járomi 等〔10〕在对459例高加索卒中患者进行rs16996148,rs17321515、rs12130333基因分型和血脂测定的研究中发现,不同等位基因的脑卒中患者的TG及TC水平无统计学差异。目前,易感基因遗传多态性在IS患者血脂代谢中的作用机制目前仍是不甚清楚的。本研究显示,不同rs12425791基因型或等位基因IS患者在TC、TG、LDL、HDL水平及异常率上的差异均无统计学意义,与Járomi等〔10〕的研究结果相类似。本研究提示,rs12425791多态性可能与IS血脂代谢无关联。但是,目前有关于rs12425791多态性与IS患者血脂代谢的相关性研究还很少,有待于更多更大样本量的同类研究来丰富研究证据。

4 参考文献

1Rothwell PM,Coull AJ,Giles MF,etal.Change in stroke incidence,mortality,case-fatality,severity,and risk factors in Oxfordshire,UK from 1981 to 2004 (Oxford Vascular Study) 〔J〕.Lancet,2004;363(9425):1925-33.

2Ikram MA,Seshadri S,Bis JC,etal.Genomewide association studies of stroke〔J〕.N Engl J Med,2009;360(17):1718-28.

3《中国成人血脂异常防治指南》制订联合委员会.中国成人血脂异常防治指南〔J〕.中华心血管病杂志,2007;35(5):390-419.

4Zhang S,Dailey GM,Kwan E,etal.An MMP liberates the Ninjurin A ectodomain to signal a loss of cell adhesion〔J〕.Genes Dev,2006;20(14):1899-910.

5张小菊,王 荔,高建英,等.高脂血症对脑缺血再灌注大鼠脑组织中MMP- 9和COX-2表达的影响〔J〕.中国临床神经科学 ,2011;19(3):270-5.

6王红卫,谢 明,何周文.脑血管患者血脂变化及调脂治疗对其预后的影响〔J〕.中南医学科学杂志,2011;39(2):207-9.

7马飞煜,邬 伟,王 凤,等.载脂蛋白E 基因多态性及脂类代谢与缺血性脑卒中亚型关系的研究〔J〕.中华老年心脑血管病杂志,2006;8(8):513-6.

8Havasi V,Szolnoki Z,Talián G,etal.Apolipoprotein A5 gene promoter region T-1131C polymorphism associates with elevated circulating triglyceride levels and confers susceptibility for development of ischemic stroke〔J〕.J Mol Neurosci,2006;29(2):177-83.

9韦叶生,蓝 艳,黄瑞雅,等.CD14基因启动子区多态性与缺血性脑卒中及血脂的相关分析〔J〕.中华老年心脑血管病杂志,2007;9(4):269-72.

10Járomi L,Csöngei V,Polgár N,etal.Triglyceride level influencing functional variants of the ANGPTL3,CILP2,and TRIB1 loci in ischemic stroke〔J〕.Neuromol Med,2011;13(3):179-86.

猜你喜欢
等位基因分型多态性
单核苷酸多态性与中医证候相关性研究进展
亲子鉴定中Penta E稀有等位基因28的确认1例
MTHFR C677T基因多态性与颈动脉狭窄及其侧支循环形成的关系
亲子鉴定中男性个体Amelogenin基因座异常1例
广东汉族人群Penta D基因座off-ladder稀有等位基因分析
贵州汉族人群23个STR基因座的OL等位基因研究
针刀治疗不同分型腰椎间盘突出症的研究进展
成人型髋关节发育不良的分型与治疗
蒙古斑在维吾尔族新生儿中分布的多态性
复杂分型面的分型技巧