不结球白菜抗根肿病渐渗系的分子辅助选育

2015-02-26 07:18陈龙正袁希汉
西北植物学报 2015年8期
关键词:根肿病结球大白菜

陈龙正,徐 海,宋 波,袁希汉

(江苏省农业科学院蔬菜研究所,南京210014)

不结球白菜抗根肿病渐渗系的分子辅助选育

陈龙正,徐 海,宋 波,袁希汉*

(江苏省农业科学院蔬菜研究所,南京210014)

该研究基于与大白菜抗根肿病连锁的分子标记,设计特异引物,获得简便实用的SCAR标记,并用于分子标记辅助选择,创制不结球白菜抗根肿病新材料。结果发现,在设计的8对特异引物中,有1对特异引物在抗、感亲本间表现出多态性。F2群体验证发现,该标记与已有SSR标记及根肿病抗性共分离,能够用于抗根肿病鉴定,定名为CRb-R-25。通过亚种间杂交并回交,利用标记CRb-R-25辅助选择将大白菜根肿病抗性转入不结球白菜中,获得抗根肿病不结球白菜渐渗系材料TQ14-1-15。

不结球白菜;抗根肿病;SCAR标记;辅助选择

不结球白菜(Brassica campestris ssp.chinensis)起源于中国,是国内尤其是南方重要的绿叶菜之一。根肿病是由芸薹根肿菌(Plasmodiophora brassicae Woronin)侵染引起的一种世界性病害。以往关于抗根肿病的研究主要集中在大白菜和甘蓝上[1-2],近年来,由于不结球白菜栽培效益好,复种指数高,土传病害逐渐成为制约不结球白菜发展的重要因素,根肿病由过去不常见的病害逐渐显露出来,并呈蔓延趋势。然而,由于不结球白菜抗根肿相关研究起步较晚,目前国内外还未发现不结球白菜根肿病抗源。通过种间或亚种间渐渗杂交可以为育种提供新的种质资源,目前已在多种作物上建立起了不同类型的渐渗系,如小麦[3]、棉花[4]、水稻[5]、玉米[6]等主要大田作物,在这些作物上已经获得能够直接用于作物品种改良的遗传稳定的渐渗系。

大白菜与不结球白菜之间的亚种间杂交亲和性较高,因此,可通过将大白菜抗根肿病基因导入不结球白菜,提高不结球白菜根肿病抗性。但是,一方面种间杂交往往导致性状的剧烈分离而不易选择,另一方面由于根肿病为土传病害,易受环境影响,不易控制,接种鉴定比较困难。因此,开发抗根肿病特异分子标记,对提高育种效率,开展分子标记辅助育种具有重要意义。Piao等[7]利用SSR标记TCR01和TCR09,将抗根肿病CRb基因定位在大白菜A3连锁群并且标记间遗传距离为2.9cM。陈慧慧等[8]根据Piao等[7]的研究开发了2个大白菜SSR标记,分别为TCR13和TCR74,标记间遗传距离为0.18cM,这些研究为大白菜抗根肿病分子标记辅助育种提供了理论基础。本研究利用携带CRb基因的大白菜种质,与不结球白菜进行亚种间杂交和回交,通过已有的SSR标记设计特异引物,以期获得更为简便快速的SCAR标记应用于分子标记辅助选择,同时结合大白菜与不结球白菜亚种间杂交创制不结球白菜抗根肿病新种质。

1 材料和方法

1.1 植物材料

供体母本为携带CRb基因的大白菜材料CCR13025,对根肿病表现为高抗,从云南省农业科学院蔬菜研究所引进。父本材料‘T青’,为江苏省农业科学院蔬菜研究提供。2011年春,将双亲及F1代种植于江苏省农业科学院蔬菜研究所实验田。F1代自交获得F2,用于标记准确性鉴定。以‘T青’为轮回亲本连续回交,从BC1代开始,根据分子标记进行选择,选择性状接近轮回亲本并且含有CRb基因的单株用于回交,获得回交后代群体BC3。

1.2 方 法

1.2.1 各世代植株抗性鉴定 ‘T青’、CCR13025、F1、F2及BC1~BC3。每个材料每次30株,3次重复,随机排列,播种于50孔穴盘。接种方法及评价分级标准同张慧等[9]。

1.2.2 多态性标记开发 在大白菜基因数据http://brassicadb.org/cgi-bin/gbrowse/Brassica_ v1.5中定位已报道的2个SSR标记TCR13(上游0.09cM)和TCR74(下游0.09cM)[8],获得物理区域为A3染色体Bra23787138~Bra23847142之间,在该区间中间设计了8对特异引物(表1),委托上海生物工程公司进行引物的合成。

1.2.3 PCR扩增 采用CTAB法提取幼嫩叶片DNA。利用1.0%琼脂糖凝胶电泳检测其完整性和纯度,用紫外分光光度计检测DNA质量和浓度,并稀释至15ng/μL。

20μL反应体系中含1×PCR缓冲液、2.0 mmol/L MgCl2、2.0mmol/L dNTP、15ng DNA、2条引物各0.5μmol/L,1UTaq酶,用ddH2O补足。PCR扩增程序:94℃预变性2min;94℃变性30s,53℃退火1min,72℃延伸2min;40个循环,72℃保温延伸5min,4℃下保存。扩增产物用1.5%琼脂糖凝胶电泳检测,在培清凝胶图像分析系统中拍照记录。扩增反应在PTC-100PCR仪上进行。

2个SSR标记TCR13和TCR74反应体系及扩增程序参考陈慧慧等[8],扩增产物用6%聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,银染染色。

2 结果与分析

2.1 抗根肿病SCAR分子标记的开发

利用2个标记TCR13和TCR74的SSR引物进行双亲及杂交、自交分离后代鉴定,发现在大白菜抗源CCR13025和杂种F1中分别携带2个标记,不结球白菜‘T青’未检到。该标记在78个F2代分离群体中按照3∶1(59∶19)的分离比例进行分离(图1),并且2个标记表现出严格的共分离现象,标记与实际接种鉴定结果相吻合,表明该标记能够用于抗根肿病材料的分子标记辅助选择。

在大白菜基因数据库http://brassicadb.org/cgi-bin/gbrowse/Brassica_v1.5中定位2个SSR标记,发现其分别位于大白菜A3染色体Bra23787138~Bra23847142之间,物理距离10006bp,在该区间设计了8对特异引物(表1),进行扩增。结果发现,在8对特异引物中,有7对在双亲和F1中没有多态性,1对引物B12525在双亲和F1之间有多态性(图2)。将该多态性引物用F2群体进行验证,结果发现,该标记与TCR13和TCR74共分离,并且与田间接种鉴定一致(图3),在所有表现抗性的单株中均能扩增到该标记,在感病单株中表现缺失。表明该SCAR标记能够用于抗根肿病分子标记辅助选择,命名为CRb-R-25。

2.2 不结球白菜抗根肿病回交后代分子选择

利用该标记进行辅助选择,以不结球白菜‘T青’为轮回亲本,进行回交并用CRb-R-25进行选择,每代选取10株表型性状最接近‘T青’并且携带标记CRb-R-25的单株作为种株留种,在每个回交世代中做自交分离,淘汰自交后代CRb-R-25标记发生分离的单株(其回交后代抗性位点为杂合的Aa类型),选择纯合的进行回交转育(抗性位点纯合AA类型)。回交3代后,BC3表型性状为典型的不结球白菜性状,大白菜原有的叶翼、叶片绒毛、白梗、包心等性状均已改良,综合性状基本接近轮回亲本‘T青’,渐渗系与轮回亲本理论遗传物质相似度为96.9%。将轮回亲本‘T青’和BC3接种根肿病菌35d后检测,结果表明,‘T青’在根部形成肿瘤,为典型的根肿病病症,而携带CRb-R-25条带的BC3单株TQ14-1-15表现抗病,根部发育正常(图4)。

3 讨 论

利用分子标记进行辅助选择具有操作简便、速度快、不受环境影响等优势,十字花科根肿病为十字花科重要的土传病害,在接种鉴定中受温度、湿度、pH值等环境因素的影响较大[10]。Piao等[7]开发了2个与大白菜抗根肿病CRb基因连锁的分子标记,TCR05和TCR09连锁距离为2.71cM。陈慧慧等[8]根据TCR05和TCR09等2个连锁标记,结合大白菜基因组序列信息,开发了TCR13(上游0.09cM)和TCR74(下游0.09cM)2个SSR标记,并将遗传距离定位在0.18cM内。在本研究中,基于大白菜基因组数据库,将2个SSR标记TCR 1 3和TCR74定位在大白菜A3染色体Bra23787138~Bra23847142之间。在本区间中设计了8条特异引物,其中1对引物与SSR标记TCR13和TCR74共分离,表明将其成功转化为SCAR标记,命名为CRb-R-25。经接种鉴定验证发现,该标记能够用于分子标记辅助选择。

在分子标记辅助选择进行抗根肿病性状转育方面,朴钟云等[11]利用Piao等[7]开发的2个与大白菜抗根肿病CRb基因连锁的分子标记TCR01和TCR09,进行大白菜与大白菜之间的抗性转育,获得9个‘BJN3’的近等基因系。目前在不结球白菜研究中未发现根肿病抗源,本研究利用抗根肿病大白菜与不结球白菜进行亚种间杂交和回交,经过3代,利用分子标记进行辅助选择,在回交过程中大白菜典型性状如叶毛、叶翼、包心等逐渐在各世代丢失,回交后代综合性状趋于轮回亲本,最终获得了携带根肿病抗性的不结球白菜种质资源TQ14-1-15,实现了提高育种效率的目的。

本研究中,通过对大白菜基因组数据库检索,在A3染色体Bra23787138~Bra23847142之间,共计有9个功能基因,这些基因既有编码细胞膜组分蛋白,也有编码蛋白质合成调控蛋白,下一步根据结合抗性鉴定,分析这些基因与根肿病抗性之间的关系,将有利于根肿病抗性基因的分离和克隆。

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(编辑:宋亚珍)

Marker-assisted Breeding of Clubroot Resistant Introgression Line in Non-heading Chinese Cabbage

CHEN Longzheng,XU Hai,SONG Bo,YUAN Xihan*
(Institute of Vegetable Crops,Jiangsu Academy of Agricultural Sciences,Nanjing 210014,China)

We designed SCAR markers according to the markers linked to clubroot resistant gene in Chinese cabbage,in order to develop the new clubroot resistant materials of non-heading Chinese cabbage through marker-assisted selection(MAS).The results indicated that one pair primer among 8showed polymorphism between parents of resistant and susceptible,and co-segregation with reported SSR marker and resistant characterization of F2,suggested that it could be used to identify the clubroot resistance,named CRb-R-25.Based on the inter-subspecies hybrid,backcross and selection of CRb-R-25,TQ14-1-15with clubroot resistance of non-heading Chinese cabbage was bred by introgression of resistance gene in Chinese cabbage.

non-heading Chinese cabbage;clubroot resistance;SCAR;marker assisted-selection

Q789

A

1000-4025(2015)08-1530-04

10.7606/j.issn.1000-4025.2015.08.1530

2015-05-05;修改稿收到日期:2015-06-10

江苏省自然科学基金(BK20130715);农业部公益性行业(农业)科研专项(201403032)。

陈龙正(1980-),男,博士,副研究员,主要从事蔬菜遗传育种研究。E-mail:lzchen@jaas.ac.cn

*通信作者:袁希汉,研究员,主要从事蔬菜遗传育种研究。E-mail:xhyuan258@163.com

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