miRNA-196a2 及miRNA-499 基因多态性与膀胱癌的相关性研究

2015-05-07 02:58窦全亮贾瑞鹏朱佳庚
医学研究生学报 2015年3期
关键词:膀胱癌多态性基因型

徐 郑,窦全亮,贾瑞鹏,朱佳庚

0 引 言

膀胱癌是泌尿系统常见的恶性肿瘤之一,是我国死亡率列于前10 位的肿瘤之一。膀胱癌的发病与多种因素相关,其中环境因素如吸烟[1]、接触化工产品、慢性感染、一些药物(如环磷酞胺、非那西汀等)及遗传因素被认为是导致膀胱癌的重要因素[2-4]。

研究显示人类基因组广泛存在的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)被证实与包括膀胱癌在内的多种肿瘤的发生相关[5]。微小RNA(microRNA,miRNA)是一类长度为21 ~23 nt的非编码单链,进化上高度保守。其主要通过靶向mRNA,降解靶mRNA 或从转录后水平抑制其翻译,从而阻断靶蛋白质的形成。研究显示miRNA 参与个体发育、器管形成、细胞增殖、分化和细胞凋亡等生物学过程[6]。此外,近年来研究显示在包括肿瘤[7]、心血管系统疾病等多种疾病的发生过程中均可以观察到miRNA 的异常表达[8]。有研究显示前体区的SNP 与多种肿瘤的发生相关,其中miR-196a2 前体区rs11614913 T >C 多态位点与多种肿瘤的发生相关,miRNA-499 前体区的多态性位点rs3746444 亦被证实与多种肿瘤的发生相关,上述2个miRNA 前体的SNP 位点与中国人群中膀胱癌发生的相关性研究报道少见[9-11]。本研究拟采用病例对照探讨miRNA 前体区rs3746444(miRNA-499)及rs11614913(miRNA-196a2)多态性位点与膀胱癌发生的相关性。

1 资料与方法

1.1 研究对象 选取2010 年1 月至2013 年12 月在我院就诊并经临床病理诊断为膀胱癌的患者283例为膀胱癌组,其中男性218 例,女性65 例,平均年龄(66.31±13.78)岁。同期选取接受健康体检的283 人为正常对照组,其中男性217 例,女性66 例。平均年龄(65.90±13.85)岁。正常对照组经体检结果显示为正常,且无泌尿系统疾病史。患者及对照组研究对象均为南京及周边地区人群,在地理分布上无差异,均为汉族。膀胱癌组与对照组性别、年龄、吸烟、饮酒等因素的差异无统计学意义(P >0.05),2 组具有可比性。本研究通过医院伦理学委员会批准,研究对象均清楚和同意该研究,并签署知情同意书。

1.2 病理诊断 病理标本由本院泌尿外科医师于手术中取出,同时取周围淋巴结与易被侵犯的远端淋巴结行病理分析,病理分析由我院病理科医师协助完成。膀胱癌依肿瘤大小(T)、淋巴结(N)和远处部位有淋巴结转移(M)(TNM)对肿瘤患者进行临床Ⅰ~Ⅳ分期;依肿瘤细胞的分化程度进行分级(高分化、中分化及低分化)。

1.3 基因组DNA 提取及检测 受试者均抽取外周血3 mL,EDTA-K2抗凝,全血经500×g 离心5 min后,去血清后在剩下的细胞中加入300 μL 人红细胞裂解液,混匀震荡3 min 溶解红细胞,10 000×g 离心30 s,沉淀白细胞,-80 ℃冻存备用;采用GoldMag全血基因组DNA 提取试剂盒(购自西安金磁纳米生物技术有限公司),按照试剂盒说明书的操作步骤提取基因组DNA。基因组DNA 浓度和纯度采用NanoDrop2000c 型蛋白核酸检测仪(购自美国Thermo公司)进行分析。

1.4 基因分型 从NCBI 数据库获取2 个基因多态性位点的序列(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/),使用Genotyping Tools 和Massarray Assay Design 软件(Sequenom 公司)设计待测SNP位点的PCR 扩增引物和单碱基延伸引物(由上海英骏生物公司合成),并对各样本进行2 个位点对应的Massarray SNP 检测,检测过程依MassARRAY©分子量阵列技术工作站标准程序进行,主要过程包括:PCR 扩增、SAP 实验、单碱基延伸PCR 实验、树脂纯化、芯片点样、质谱分析、实验结果分析与整理。实验由陕西佰美基因股份有限公司协助完成。

1.5 统计学分析 采用SPSS 11.0 统计软件进行分析。计量资料以均数±标准差()表示,组间比较采用两独立样本t 检验;计数资料以频数和率表示,组间比较采用χ2检验,以P≤0.05 为差异有统计学意义。多态性位点的基因型与患病风险的关系分析采用二元Logistic 回归分析,以OR 及95%CI表示相对风险度。

2 结 果

2.1 Hardy-Weinberg 平衡检验 对照组基因型进行Hardy-Weinberg 平衡检验,结果显示2 个位点均符合Hardy-Weinberg 平衡(P >0.05),提示样本来自一个稳定的群体。

2.2 基因多态性位点与肿瘤病理特征的相关性

将膀胱癌组依肿瘤的病理特征(肿瘤分期、周围淋巴结转移、远端淋巴结转移及肿瘤的分化程度)进行分组。χ2检验结果显示在不同分化程度的肿瘤分组中2 个位点的基因型差异有统计学意义(P <0.05)。见表1。

表1 rs11614913 及rs3746444 与膀胱癌病理参数的频数分布[n(%)]Table 1 Frequency distribution of rs11614913,rs3746444 and clinicopathological parameters of bladder cancer n(%)

2.3 基因多态性位点基因型的分布 2 个位点的基因分型分布,经多因素Logistic 回归分析,在调整了性别、年龄、吸烟和饮酒因素后,结果显示rs11614913位点的各基因型在2 组中分布差异有统计学意义(χ2=15.077,P <0.001),其中TT 基因型在病例组中的频率显著低于对照组,差异有统计学差异(P <0.05)。rs3746444 位点的各基因型在2 组中分布差异无统计学意义(χ2=5.107,P=0.078),但回归分析发现GG 基因型在病例组中分布显著高于对照组,组间差异有统计学意义(P <0.05)。见表2。

表2 rs11614913 及rs3746444 多态性与膀胱癌发病风险的Logistic 回归分析Table 2 Logistic regression analysis on the association of rs11614913 and rs3746444 to the risk of bladder cancer

3 讨 论

MicroRNA 基因多态性与肿瘤的相关性已被广泛关注,其中rs11614913(miRNA-196a2)及rs3746444(miRNA-499)2 个位点是近年来研究的热点。在中国人群中,Yuan 等[12]对rs11614913 位点与肺癌的相关性进行了探讨,结果发现rs11614913 C 等位基因与肺癌的危险性增加有关。此外,Hu 等[13]的研究亦发现rs11614913 C 等位基因与中国妇女乳腺癌的危险性增加有关。本研究基于南京地区汉族人群,发现rs11614913 TT 基因型与膀胱癌的发生呈现负相关,与上述在中国人群中其他类型肿瘤的结果相一致。Hoffman 等[14]对该多态性位点的等位基因的功能进行了研究,结果显示rs11614913C 等位基因与miR-196a2 的低表达量相关,进而影响了其调控靶基因的能力,影响DNA 损伤后应答的效率。此外,He 等[9]荟萃分析结果显示,亚洲人群中rs11614913 TT 与肿瘤发生呈负相关(TT vs CC:OR=0.80,95%CI:0.73 ~0.88;TT vs CC+CT:OR=0.85,95%CI:0.80 ~0.92)。上述研究结果均与本研究结果一致。

MiRNA-499 rs3746444 基因多态性与肿瘤的相关性已经广泛研究。荟萃分析结果显示该位点与肿瘤的发生相关[9,11,15];在中国人群中亦有研究发现该基因多态性与肝癌的发生相关[16];还有研究显示该位点在亚洲人群中呈现相关性[17-18];而在欧洲人群中未显示有相关性[19]。此外,功能研究亦显示miRNA-499 可以和c-MET mRNA 结合并降低其表达,进而促进细胞的凋亡并抑制细胞的增殖[20]。本研究结果显示rs3746444GG 基因型与膀胱癌的发生相关,与上述的研究结果相一致。

本研究还将膀胱癌组依肿瘤的病理特征进行分组,对上述基因多态性位点的基因型分布进行了χ2检验,结果显示上述2 个位点的基因型分布频率在肿瘤分期、周围淋巴结转移及远端淋巴结转移的分组中差异无统计学意义。然而,在不同分化程度的肿瘤分组中2 个位点的基因型分布频率差异有统计学意义。本研究所探讨的2 个多态性位点已被证明有生物学功能,与肿瘤的发生相关,但与肿瘤分化的相关性还未见相关报道,因此该结果还需进一步研究探讨。此外,本研究所纳入的病例数相对较少,因此进行分化程度分组后统计学效应较弱,rs11614913(miRNA-196a2)及rs3746444(miRNA-499)与肿瘤分化程度相关的结论还有待于更大样本的研究来进一步证实。

综上所述,本研究发现rs11614913(miRNA-196a2)及rs3746444(miRNA-499)基因多态性与膀胱癌的发生相关,2 个位点的基因多态性与肿瘤的分化程度相关,相关分子机制还需进一步的研究证实。

[1] Strope SA,Montie JE.The causal role of cigarette smoking in bladder cancer initiation and progression,and the role of urologists in smoking cessation[J].J Urol,2008,180(1):31-37.

[2] Clapp RW,Jacobs MM,Loechler EL.Environmental and occupational causes of cancer:new evidence 2005-2007[J].Rev Environ Health,2008,23(1):1-37.

[3] 程 文,徐 锋,刑潇潇,等.310 例膀胱癌综合治疗病例的临床分析[J].医学研究生学报,2013,26(12):1282-1285.

[4] 杨德林,霍 倩,王乙水,等.基质细胞衍生因子-1 及其受体CXCR4 对膀胱癌细胞侵袭能力及腔内种植的影响[J].医学研究生学报,2014,27(10):1028-1032.

[5] Wojcicka A,de la Chapelle A,Jazdzewski K.MicroRNA-related sequence variations in human cancers[J].Hum Genet,2014,133(4):463-469.

[6] 江胜林,凌秀风,张军强.MicroRNAs 在早期胚胎发育中的研究进展[J].医学研究生学报,2014,24(4):746-749.

[7] Esquela-Kerscher A,Slack FJ.Oncomirs-microRNAs with a role in cancer[J].Nat Rev Cancer,2006,6(4):259-269.

[8] 吴彩云,张春妮.MicroRNA 与神经胶质瘤关系的研究进展.医学研究生学报,2014,27(7):746-750

[9] He B,Pan Y,Cho WC,et al.The association between four genetic variants in microRNAs(rs11614913,rs2910164,rs3746444,rs2292832)and cancer risk:evidence from published studies[J].PLoS One,2012,7(11):e49032.

[10] Wang P,Xie S,Cui A,et al.miR-196a2 polymorphisms and susceptibility to cancer:A meta-analysis involving 24,697 subjects[J].Exp Ther Med,2012,3(2):324-330.

[11] Wang F,Sun G,Zou Y,et al.Association of microRNA-499 rs3746444 polymorphism with cancer risk:evidence from 7188 eases and 8548 controls[J].PLoS One,2012,7(9):e45042.

[12] Yuan Z,Zeng X,Yang D,et al.Effects of common polymorphism rs 11614913 in Hsa-miR-196a2 on lung cancer risk[J].PLoS One,2013,8(4):e616047.

[13] Hu Z,Liang J,Wang Z,et al.Common genetic variants in premicroRNAs were associated with increased risk of breast cancer in Chinese women[J].Hum Mutat,2009,30(1):79-84.

[14] Hoffman AE,Zheng T,Yi C,et al.MicroRNA miR-196a-2 and breast cancer:a genetic and epigenetic association study and Functional analysis[J].Cancer Res,2009,69(14):5970-5977.

[15] Wang Y,Yang B,Ren X.Hsa-miR-499 polymorphism(rs3746444)and cancer risk:a meta-analysis of 17 case-control studies[J].Gene,2012,509(2):267-272.

[16] Xiang Y,Fan S,Cao J,et al.Association of the microRNA-499 variants with susceptibility to hepatocellular carcinoma in a Chinese population[J].Mol Biol Rep,2012,39(6):7019-7023.

[17] Qiu MT,Hu JW,Ding XX,et al.Hsa-miR-499 rs3746444 polymorphism contributes to cancer risk:a meta-analysis of 12 studies[J].PLoS One,2012,7(12):e50887.

[18] Chen P,Zhang J,Zhou F.MiR-499 rs3746444 polymorphism is associated with cancer development among Asians and related to breast cancer susceptibility[J].Mol Biol Rep,2012,39(12):10433-10438.

[19] Wang L,Qian S,Zhi H,et al.The association between hsamiR-499 T >C polymorphism and cancer risk:a meta-analysis[J].Gene,2012,508(1):9-14.

[20] Buurman R,Gürlevik E,Schäffer V,et al.Histone deacetylases activate hepatocyte growth factor signaling by repressing microRNA-449 in hepatocellular carcinoma cells[J].Gastroenterology,2012,143(3):811-820.

猜你喜欢
膀胱癌多态性基因型
单核苷酸多态性与中医证候相关性研究进展
VI-RADS评分对膀胱癌精准治疗的价值
外泌体长链非编码RNA在膀胱癌中的研究进展
CLOCK基因rs4580704多态性位点与2型糖尿病和睡眠质量的相关性
Analysis of compatibility rules and mechanisms of traditional Chinese medicine for preventing and treating postoperative recurrence of bladder cancer
上海郊区牛病毒性腹泻病毒(BVDV)基因型分析
膀胱癌患者手术后症状簇的聚类分析
蒙古斑在维吾尔族新生儿中分布的多态性
作物遗传育种研究进展Ⅴ.表型选择与基因型选择
ZNF804A rs1344706多态性与精神分裂症的关联分析