耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌基因检测及同源性分析*

2016-01-11 09:20陆丹倩芮勇宇顾向明王巧媚邓聚辉
现代检验医学杂志 2016年6期
关键词:烯酶烯类鲍曼

陆丹倩,芮勇宇,杨 秋,顾向明,邓 冲,王巧媚,邓聚辉

(1.广东省中山市中医院检验科,广东中山 528400;2.南方医科大学南方医院,广州 510515)

鲍曼不动杆菌(acinetobacterbaumannii,Ab)是一种专性需氧的非发酵革兰阴性球杆菌,属于条件致病菌,引起多重耐药并体外生存时间长(数月),易造成流行,对其临床治疗造成较大的困难。鲍曼不动杆菌的耐药机制主要是产碳青霉烯酶水解酶,碳青霉烯酶按Ambler法,分为A,B和D三类,本文主要是中山市中医院2012~2013年临床分离出的40株耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)进行B类金属酶、D类苯唑西林酶以及ERIC-PCR法聚类分析的研究,以了解我院CRAB的耐药机制及流行克隆的情况。

1 材料与方法

1.1 研究对象 40株耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌来自我院2012年7月~2013年12月住院患者送检痰液29份、伤口分泌物9份、血液及尿液各1份标本,其中临床分布ICU 18株、内科10株、骨科7株及外科5株,同一患者留取初次分离菌株。

1.2 仪器及试剂 美国BD公司PhoenixTM100全自动细菌及药敏鉴定仪,PCR扩增仪器(德国Eppendorf),凝胶成像仪(Bio-Rad)。dNTPs TaqDNA聚合酶、蛋白酶K和DNA Marker由大连瑞真生物技术有限公司提供。PCR引物由上海英潍捷基贸易有限公司合成。Tris饱和酚、氯仿、异戊醇、10%十二烷基磺酸钠由北京鼎国生物技术有限公司提供。

1.3 方法

1.3.1 细菌DNA模板制备:用SDS-蛋白酶K-酚-氯仿方法提取,加入适量缓冲液III(10 mmol/L Tris-HCl pH8.0,1 mmol/L EDTA)溶解DNA沉淀,-20℃保存备用。

1.3.2 PCR方法检测常见碳青霉烯酶基因:PCR分别检测B类金属酶基因NDM,VIM,IMP[1],多重PCR同时扩增D类OXA类酶基因OXA-23-like,OXA-24-like,OXA-51-like,OXA-58-like 4个基因[2]。

1.3.3 ERIC-PCR:进行ERIC-PCR基因分型[3]。1.5 g/dl琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物。利用Quantity one 软件进行ERIC-PCR图谱的分析。

2 结果

2.1 碳青霉烯酶基因检测结果 40株CRAB中,OXA-51-like阳性40株占100%,OXA-23-like阳性38株占95%,未检出NDM,VIM,IPM,OXA-24-like及OXA-58-like。电泳结果见图1。

2.2 ERIC-PCR基因分型结果 相似性聚类分析结果,40株菌相似水平大于80%(图中虚线所示),可认为是同一克隆群。这40株菌在相似水平被聚为33个类群(克隆株)。见图2。

OXA51 OXA23

图2 ERIC-PCR基因分型电泳图谱及聚类图

3 讨论

目前,由于广谱抗菌素在临床广泛应用,导致鲍曼不动杆菌引起的感染检出率逐年升高,随多重耐药、泛耐药、全耐药的鲍曼不动杆菌的出现[4,5],已成为全球性临床治疗的难题。鲍曼不动杆菌产碳青霉烯酶是它的主要耐药机制,碳青霉烯酶主要包括A,B和D三类酶,本文主要针对B类金属酶,目前常见的NDM,VIM及IPM,D类苯唑西林酶,鲍曼不动杆菌常见OXA-23-like,OXA-24-like,OXA-51-like及OXA-58-like进行检测。

本实验检测40株CAAB的结果显示以痰标本最多[6,7],成为呼吸系统感染的主要致病菌[8]。而分布的科室主要是以ICU为主[9,10], 这可能与ICU病区多为老年患者且住院时间长病情严重、机体免疫力差,多有严重基础疾病,大量使用广谱抗生素及各种侵入性检查和治疗等有关。

碳青霉烯酶基因检测结果显示未检出B类金属酶NDM,VIM及IPM,提示本地区鲍曼不动杆菌可能未携带此3种耐药基因。D类苯唑西林酶,检出40株OXA-51-like阳性占100%,38株OXA-23-like阳性占95%,未检出OXA-24-like及OXA-58-like。说明本地区鲍曼不动杆菌的基因型是以OXA-51-like和OXA-23-like为主,与王丽娟等[11]报道一致。OXA-51是鲍曼不动杆菌的重要标志,它是鲍曼不动杆菌的固有基因[12], 以区别于其他不动杆菌属,水解碳青霉烯酶类药物能力较弱,并不能水解头孢菌素类药物。OXA-23能介导细菌耐碳青霉烯类药物,它是目前流行传播最广的D类碳青霉烯类基因,与国内外报道一致[13~15]。

为了了解本院近两年临床分离出的40株CRAB是否存在医院感染流行及暴发,对临床分离出的40株CRAB进行ERIC-PCR基因分型,研究其传播机制。ERIC-PCR是肠杆菌科基因重复序列为引物进行PCR扩增出多态性DNA图谱。它操作简便、快速经济、重复性较好,是研究多重耐药、泛耐药及全耐药菌传播机制的首选方法。检测的40株菌均能扩增出条带,分辨率高,40株CRAB菌相似水平大于80%(图中虚线所示),可认为是同一克隆群。这40株菌在相似水平被聚为33个类群(克隆株)[16]。

碳青霉烯酶基因检测及ERIC-PCR基因分型的检测结果均显示,本院近两年临床分离出的40株CRAB具有高度的相似性,亲缘关系紧密,可认为是同一克隆群,提示本院存在CRAB的克隆现象可能已经发生,且携带OXA-23-like及OXA-51-like基因是引起其耐碳青霉烯类药物的主要原因之一,而且也是造成CAAB不断增加的原因。因此,应规范临床合理使用抗菌药物,加强对本地区CRAB耐药性及耐药机制的监测及关注,加强手卫生,患者隔离,环境清洁消毒等感控措施,避免在医院内的进一步传播,这对指导临床合理用药及避免CA-AB医院感染暴发流行具有重要意义。

[1] Poirel L,Walsh TR,Cuvillier V,et al.Multiplex PCR for detection of acquired carbapenemase genes[J].Diagn Microbiol Infect Dis,2011,70(1):119-123.

[2] Woodford N,Ellington MJ,Coelho JM,et al.Multiplex PCR for genes encoding prevalent OXA carbapenemases inAcinetobacterspp[J].Iut J Antimicrob Agents,2006,27(4):351-353.

[3] Wei Q,Hu Q,Li S,et al.A novel functional class 2 integron in clinical proteus mirabilis isolates[J].J Antimicrob Chemother,2014,69(4):973-976.

[4] 汪 复,朱德妹,胡付品,等.2012年中国CHINET细菌耐药性监测[J].中国感染与化疗杂志,2013,13(5):321-330.

Wang F,Zhu DM,Hu FP,et al.CHINET surveillance of bacterial resistance in China in 2012[J].Chinese Journal of Infection and Chemotherapy,2013,13(5):321-330.

[5] 胡付品,朱德妹,汪 复,等.2013年中国CHINET细菌耐药性监测[J].中国感染与化疗杂志,2014,14(5):365-374.

Hu FP,Zhu DM,Wang F,et al.CHINET surveillance of bacterial resistance in China in 2013[J].Chinese Journal of Infection and Chemotherapy,2014,14(5):365-374.

[6] 阿孜古丽·阿布都热合曼,阿尔孜古力·吐尔逊.临床鲍曼不动杆菌生物膜检测及耐药性分析[J].现代检验医学杂志,2013,28(4):116-118.

Arzigul·Abramovich,Aerziguli·tursun.Biofilm detection and drug resistance analysis of clinicalBaumanAcinetobacter[J].Journal of Modern Laboratory Medicine,2013,28(4):116-118.

[7] 秦智谦,常 毅,郝万鹏.乌鲁木齐地区鲍曼不动杆菌感染的临床分布及耐药性分析[J].现代检验医学杂志,2015,30(4):77-79.

Qin ZQ,Chang Y,Hao WP.Analysis of clinical distribution and drug resistance ofAcinetobacterinfectionin Urumqi area[J].Journal of Modern Laboratory Medicine,2015,30(4):77-79.

[8] 陈佰义,何礼贤,胡必杰,等.中国鲍曼不动杆菌感染诊治与防控专家共识[J].中华医学杂志,2012,92(2):76-85.

Chen BY,He LX,Hu BJ,et al.Expert consensus on diagnosis and control ofAcinetobacterinfectionin China Bauman[J].Natl Med J Chin,2012,92(2):76-85.

[9] 毛 璞,李建春,邱桂霞,等.重症监护病房耐碳青霉烯类抗生素鲍曼不动杆菌耐药机制研究[J].中国感染与化疗杂志,2015,15(3):253-256.

Mao P,Li JC,Qiu GX,et al.Mechanism of carbapenem resistance in the Acinetobacter baumannii isolates from an intensive care unit[J].Chinese Journal of Infection and Chemotherapy,2015,15(3):253-256.

[10] 郭 洁,徐 杰,王丽丽,等.耐碳青霉烯类抗生素鲍曼不动杆菌的耐药谱分析[J].现代检验医学杂志,2012,27(1):107-109.

Guo J,Xu J,Wang LL,et al.Antibiotics resistance profiles of carbapenem-resistantAcinetobacterBaumanniiisolates[J].Journal of Modern Laboratory Medicine,2012,27(1):107-109.

[11] 王丽娟,季 萍,张朝霞.乌鲁木齐地区耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌碳青霉烯酶基因型及同源性分析[J].现代检验医学杂志,2011,26(3):72-75.

Wang LJ,Ji P,Zhang ZX.Study on the homology and carbapenemases genotypes of imipenem-resistantAcinetobacterbaumanniistrains from Urumqi region[J].Journal of Modern Laboratory Medicine,2011,26(3):72-75.

[12] 钟 敏,黄文芳.耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌产OXA酶的研究进展[J].中国微生态学杂志,2013,25(1):122-125.

Zhong M,Huang WF.Research advances of oxaclil-linase in carbapenem-resistantAcinetobacterBaumannill[J].Chinese Journal of Microecology,2013,25(1):122-125.

[13] 马传玲,张 环,徐春泉,等.鲍曼不动杆菌blaoxA-23和armA等耐药基因的检测和流行特性研究[J].中华传染病杂志,2015,33(4):210-214.

Ma CL,Zhang H,Xu CQ,et al.Detection and epidemiology of drug resistance related blaoxA-23and armA genes ofAcinetobacterBaumannii[J].Chinese Journal of Infectious Diseases,2015,33(4):210-214.

[14] 杨正海,李小宁.碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌OXA酶基因研究[J].中国抗生素杂志,2015,40(3):203-207.

Yang ZH,Li XN.Study on genes of oxacillinase in carbapenem-resistantAcinetobacterBaumannii[J].Chinese Journal of Antibiotics,2015,40(3):203-207.

[15] 卜劲松,王 勇.耐碳青霉烯类药物鲍曼不动杆菌的碳青霉烯酶、整合酶基因型研究[J].检验医学,2015,30(6):626-630.

Bu JS,Wang Y.Study on carbapenemase and integrase genotypes of carbapenem-resistantAcinetobacterBauman[J].Laboratory Medicine,2015,30(6):626-630.

[16] 余 清,罗 君,蒋 维.院内鲍曼不动杆菌耐药谱分析及相关β-内酰胺酶基因分布情况调查[J].现代检验医学杂志,2015,30(6):60-63.

Yu Q,Luo J,Jiang W.Study on the characteristic of drug resistance and β-lactamase genes inAcinetobacterbaumannii[J].Journal of Modern Laboratory Medicine,2015,30(6):60-63.

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