浅谈犬库布病毒及检测方法

2017-06-05 14:58阳爱国
兽医导刊 2017年2期
关键词:胃肠炎浅谈病毒

侯 巍 阳爱国 郭 莉 莫 西

(四川省动物疫病预防控制中心,四川成都 610041)

浅谈犬库布病毒及检测方法

侯 巍 阳爱国 郭 莉 莫 西

(四川省动物疫病预防控制中心,四川成都 610041)

犬库布病毒(Canine Kobuviruses,CaKoV)属于小RN A病毒科(Picornaviridae)A型爱知病毒(Aichivirus A)属。研究表明犬库布病毒(Canine Kobuviruses)与犬病毒性腹泻存在一定相关,2011年该病毒第一次在美国从患急性胃肠炎的犬中检测出[1],而后中国[2]、非洲[3]、意大利[4]、英国[5]等国家相继被发现。

库布病毒;检测

1 犬库布病毒的简史

1.1 犬库布病毒的发现及其分类

库布病毒属于小RNA病毒科中新增加的属。2011年,从美国患有急性胃肠炎的犬中检测出第一株犬库布病毒。根据基因序列分析,其距离AiV基因A和B型,因此研究人员对这些病毒命名为犬科库布病毒(CaKoV)[1]。研究证明[2]- [7],库布病毒通过被污染的食物或水粪-口途径感染,并且它们在人和动物[8][9]的胃肠炎中具有潜在的致病作用[10]。

根据基因序列分析显示,CaKoV在遗传上接近小鼠库布病毒M-5(在氨基酸水平同源性84.0%)[4]与 AiV(在氨基酸水平同源性达80.0%)[11]。根据国际病毒分类学委员会(ICTV)制定的标准(小RNA病毒科内,如果在P1、P2和P3区域氨基酸具有40%、40%和50%同源性,就可以归为一属),因此CaKoV可以被认为是来自鼠科布病毒(MuKoV 1型)和人类AiV(AiV1型)的不同基因型(CaKoV 1型),同属爱知A型[12]。

1.2 犬库布病毒的流行

犬库布病毒的国内外流行情况见表1

表1 犬库布病毒流行情况表

2 犬库布病毒基因结构

犬库布病毒是一种极小的球形病毒,直径约为 30nm,二十面体、无囊膜的单股正链 RNA 病毒。与所有的微RNA 病毒一样,CaKoV成员具有相似的基因组结构:包括 5- UTR、一个大的开放阅读框(open reading frame,ORF)、3-UTR以及Poly(A)tail。ORF编码的蛋白依次为L(非结构蛋白)、VP0、VP3和VP1(结构蛋白)、2A-2B-2C(非结构蛋白)和3A-3B-3C-3D(非结构蛋白)。

根据Genbank载录的全基因序列分析中国株CH-1,韩国株12D049,英国株UK003, 美国株US-PC0082。中国CH-1株长度为8216bp,韩国12D049株长度为8292bp,英国UK003株的长度为8213bp。

3 病毒的鉴定

3.1 病毒的培养

病毒分离培养是鉴定病原行之有效的方法,AiV可以在Vero或BS-C-1细胞上增殖并能观察到明显的细胞病变[13]。

3.2 病毒的检测

3.2.1 免疫学检测方法

2016年日本学者通过酶联免疫吸附的方法在犬的粪便中成功检测到AiV[14]。此外,报道称,有研究学者在198只狗血清样品和97只猫血清样品中检测到爱知病毒IgG抗体的,分别为74只(37.4%)的67只(69.9%),检测到的抗体最高滴度为1:2000。

3.2.2 分子生物技术

由于PCR 方法具有敏感、快速、特异及可重复性的优点,因此对于CaKoV的检测大都采用了RT-PCR 的方法。由于CaKoV的致病性及其机制尚不清楚,临床诊断也无法进行,基因检测可能是在未来很长时间内的主要检测方法见表2。

表2 检测犬库布病毒方法

[1] Kapoor A,Simmonds P,Dubovi E J,et al. Characterization of a canine homolog of human Aichivirus[J].Journal of Virology,2011,85 (21):11520-11525.

[2] Li C,Wei S,Guo D,et al. Prevalence and phylogenetic analysis of canine kobuviruses in diarrhoetic dogs in northeast China[J].Journal of Veterinary Medical Science,2015,78(1):70-74.

[3] Olarte-Castillo X A,Heeger F,Mazzoni C J,et al.Molecular characterization of canine kobuvirus in wild carnivores and the domestic dog in Africa[J].Virology,2015,477(3):89-97.

[4] Di M B,Di F E,Ceci C,et al. Canine kobuviruses in diarrhoeic dogs in Italy[J].Veterinary Microbiology,2013,166(1):246-249.

[5] Carmonavicente N,Buesa J,Brown P A,et al. Phylogeny and prevalence of kobuviruses in dogs and cats in the UK[J].VeterinaryMicrobiology,2013,164(3-4):246-252.

[6] Soma T,Matsubayashi M,Sasai K. Detection of kobuvirus RNA in Japanese domestic dogs[J]. Journal of Veterinary Medical Science,2016,78(11):117.

[7] Choi S,Lim S I,Yong K K,et al. Phylogenetic Analysis of Astrovirus and Kobuvirus in Korean Dogs[J].Journal of Veterinary Medical Science,2014,76(3):1141-1145.

[8] Khamrin P,Maneekarn N,Okitsu S,et al. Epidemiology of human and animal kobuviruses[J].VirusDisease,2014,25(2):195-200.

[9] Felix D J,Sigrid B,Souza L L K D,et al. Aichi virus shedding in high concentrations in patients with acute diarrhea[J].Emerging Infectious Diseases,2011,17(8):1544-1548.

[10] Ambert-Balay K,Lorrot M,Bon F,et al. Prevalence and genetic diversity of Aichi virus strains in stool samples from community and hospitalized patients[J].Journal of Clinical Microbiology,2008,46 (4):1252-1258.

[11] Phan TG,Kapusinszky B,Wang C,et al. The fecal viral flora of wild rodents[J].PLoS Pathog,2011,(7):218.

[12] Knowles N J,Hovi T,Hyypiä T,et al. Virus Taxonomy,Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses:Picornaviridae[J]. 2012,(5):855-881.

[13] Y amashita T,Kobayashi S,Sakae K,et al. Isolation of cytopathic small round viruses with BS-C-1 cells from patients with gastroenteritis[J].The Journal of Infectious Diseases,1991,164 (5):954-957.

[14] Wang C,Lan D,Cui L,et al. Molecular characterization of a porcine kobuvirus strain in China.[J].Archives of Virology,2012,157(3):573-578.

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