变异

  • 基于矩阵的并发关系挖掘算法在新冠病毒变异分析中的应用
    引 言新冠病毒变异株中最受关注的是Delta、Omicron、Alpha、Gamma、Beta、Lambda、Mu 变异株。以上变异株或是增加了毒性,或是增强了传播性,某些变异株还会降低疫苗效用,对公共卫生构成重大威胁[1]。因此,对于新冠病毒突变的研究至关重要。考虑到DNA 序列的特殊性,已经有许多专门针对DNA序列挖掘的算法,如ToMMSA、ATRHunter 等[2]。机器学习也被应用到DNA 序列挖掘[3]。至今已经有许多研究人员在针对SARS-

    物联网技术 2023年9期2023-09-21

  • 群体基因组结构变异检测工作流
    01)基因组结构变异(Structural Variation,SV)是基因组上大尺度的核苷酸序列重排性变化,它包括长度大于50 bp的插入(INS)、缺失(DEL)、倒位(INV)、重复(DUP)、易位(BND)[1]。相关研究表明,平均每个人类个体上存在大约两万个结构变异[2],结构变异尽管相较于单核苷酸变异(SNV)、短插入缺失变异(INDEL)数量较少,但因其变异长度较大,因此对基因组上核苷酸序列的影响是最广泛的[3]。结构变异会改变基因序列信息,

    生物信息学 2021年4期2021-12-31

  • 世卫改用希腊字母命名变异新冠病毒
    腊字母对新冠病毒变异株进行命名。目前,有4种变异新冠病毒被WHO列为“须关切变异株”,另外6种变异新冠病毒则被列为“待观察变异株”,这些变异病毒都会采用新命名法。据路透社1日报道,按照WHO新的命名规则,最早在英国发现的学名为B.1.1.7变异病毒,将被称为“阿尔法”(Alpha);最早在南非发现的B.1.351变异病毒,将被称为“贝塔”(Beta);最早在巴西发现的P.1变异病毒,将被称为“伽马”(Gamma);以上三种均被列为“须关切变异株”。最早在印

    环球时报 2021-06-022021-06-02

  • 四季海棠无性系变异离体筛选与变异频率控制
    质逐渐降低、株型变异、叶色变化,抗性变差。四季海棠无性系建立是进行种苗快速繁殖的有效方法之一[5],而四季海棠品种无性系建立过程中,也会有一定变异性状的出现。无性系变异的发生,严重影响了应用组培技术进行快繁的产业化生产效益[2]。变异苗观赏性及再生能力差,采用无性提纯的方法剔除变异植株,筛选优质种苗。目前,对四季海棠组培苗变异的研究空白,但变异在建立无性系过程中日益突出的不利影响逐渐显现,组培变异的筛选和控制显得愈加重要。1 材料与方法1.1 材料以四季海

    农业科学研究 2021年1期2021-05-12

  • Randoop 和Evosuite 生成测试用例的变异检测能力分析
    的一种常用方法是变异测试。变异测试将人工缺陷(变异体)种植到被测代码中,并评估测试用例是否找到它们。当一个测试用例检测到一个变异体时,说明该变异体被杀死[1],否则变异体仍然存活。本文选择Randoop 和Evosuite 这两个积极维护的自动化生成单元测试的工具,muJava 变异工具,以数据结构教材中的基本数据结构项目作为被测项目进行变异测试,通过比较Evosuite、Randoop 生成的测试用例的变异检测能力,以回答下面2 个研究问题:问题1:两个

    现代计算机 2020年9期2020-04-25

  • 北洛河流域分期径流变异诊断及成因分析
    注变化环境对水文变异的影响[1]。联合国政府间气候变化专门委员会(IPCC)在1990年就提出了气候变化问题,2014年发布的报告[2]则明确指出,全球性的水循环系统、冰雪消融情况、海平面变化以及极端天气出现的频率、程度都发生了显著变化,与之关系紧密的气候变化和人类活动引发了水文系列变异问题。国内外的相关研究表明,美国多条河流的水文系列在20世纪后期发生了明显变异[3],我国的海河、黄河、渭河等流域的径流系列均发生了显著变异[4-7]。在实际生产应用中,水

    水资源保护 2019年6期2019-12-03

  • 基于SOM神经网络的二阶变异体约简方法∗
    010021)变异测试[1]是一种通过向源程序中人工注入缺陷来模拟软件中实际缺陷的技术,被注入缺陷的程序称为变异体.传统的变异测试是指一阶变异测试,即通过向源程序中人工注入一个缺陷来模拟软件中的一个缺陷[2].但程序中的实际缺陷往往是由两个或者更多个缺陷一起造成的[3,4],所以高阶变异测试被提出来用以解决程序中复杂缺陷的问题,在模拟程序的复杂缺陷方面有着重要意义[5].由一阶变异体组合形成的高阶变异体数量会大量增加,大大增加了执行开销[6,7].因此,

    软件学报 2019年5期2019-06-11

  • JQuery变异算子的冗余检测
    m[3]提出一种变异测试的方法,并广泛应用在各个语言的软件上.虽然变异测试已经被证明了在提高测试用例的质量上是有效的,但是测试成本也随之增加,这取决于生成的变异体的数量和产生等价变异体的百分比.为了降低变异测试的成本,国际上许多学者提出了几种可行的方法.A.J.Offutt和R.H.Untch[4]把这些方法分为了三类,即减少变异、更好的算法以及更快生成和运行.将这三类办法应用在变异测试分析中,可以大幅降低变异测试的成本,剔除测试过程中的不必要的开销.A.

    小型微型计算机系统 2019年4期2019-05-05

  • 面向WS-BPEL程序的变异测试优化技术
    战性问题[3].变异测试是一种基于故障的软件测试技术[4],具有较强的故障检测能力,广泛用于评估测试用例集的完备性和测试技术的有效性[5].然而,由于变异测试产生的变异体数量庞大、等价变异体识别困难、缺乏相应自动化支持工具等原因,变异测试难以在实际中广泛应用.在WS-BPEL变异测试方面,人们提出面向WS-BPEL程序的变异算子[6],为WS-BPEL程序的变异测试提供基础[7].在课题组前期研究工作中[8-10],我们提出了一种面向WS-BPEL程序的变

    计算机研究与发展 2019年4期2019-04-18

  • 一种针对Java程序的充分变异算子集
    621010)变异测试[1](Mutation Testing)是一种基于缺陷的软件测试方法,基本原理是使用变异算子(Mutants Operator)对被测程序做微小的合乎语法的变动,改变过后得到的程序被称为变异体(Mutants)。在产生变异体后,分别在原程序和变异体上运行测试用例,如果二者的结果相同,则表示该变异体是存活的(Alive),如果二者的结果不同,则表示该变异体是被杀死的(Killed)。如果一个变异体在语义上和原程序保持一致,那么它将无

    西南科技大学学报 2018年3期2018-09-27

  • 基于变异点的选择性变异测试
    业界的高度重视。变异测试是一种基于错误的软件测试方法,自20世纪70年代产生以来,经过近50年的发展,变异测试技术日趋成熟,大量实证研究表明[1-4],相对于路径分析、数据流分析和域分析等测试方法,变异测试能够更为有效地检测软件故障。变异测试通过向待测程序注入微小的语法错误,得到大量被称为变异体的错误程序,从原程序生成变异体的转换规则被称为变异算子,变异算子主要通过替换、删除和插入三种方式更改程序中的变量或表达式,从而生成变异体,而变异发生的位置被称为变异

    现代计算机 2018年7期2018-04-24

  • 实时荧光定量PCR法检测乙型肝炎病毒YMDD变异的临床意义
    肝炎病毒YMDD变异的临床意义陈继梅1,胡娅娴1,戴阳2目的:探讨拉米夫定治疗慢性乙型肝炎期间发生乙型肝炎病毒HBV YMDD变异情况及其与病毒载量、肝功能的关系。方法:对慢乙肝患者分别检测血清HBV YMDD变异、HBV DNA 载量及肝功能,并对检验结果进行分析。结果:3年间共发生HBV YMDD变异共59例,其中HBV YIDD变异29例(49.15%),HBV YVDD变异41(69.49%)例,2者共同变异11(18.64%)例,YIDD与YVD

    淮海医药 2017年4期2017-07-31

  • 乙型肝炎病毒前C/基本核心启动子区变异的生物学意义
    基本核心启动子区变异的生物学意义向 瑶 综述,杨朝国△审校 (成都中医药大学医学技术学院,成都 610075)乙型肝炎病毒; 前C区基因; 基本核心启动子; 突变乙型肝炎病毒(HBV)基因组变异率约为其他DNA病毒的104倍,主要原因:(1)HBV复制是以mRNA为模板反转录合成子代病毒DNA,该过程中缺乏校对酶的作用,容易发生碱基错配;(2)在内源性(宿主免疫清除)和外源性(疫苗接种、乙型肝炎免疫球蛋白注射、抗病毒药物治疗和诊断试剂检测)选择性压力下,H

    检验医学与临床 2015年21期2015-04-16

  • 血压变异对接受降压治疗的急性颅内出血预后的影响
    可能存在每日血压变异,迄今关于每日血压变异与接受降压治疗的急性ICH 近期不良预后间关系尚不清楚,现就此进行分析。受试对象为205例急性ICH 患者,平均年龄65岁。均于急性ICH 超急期(发病<3 h 内)接受降压治疗,且初始收缩压(SBP)均>180 mm Hg(1 mm Hg=0.133 3 kPa),降压靶标均为使SBP 降至120~160 mm Hg,降压药均为静注尼卡地平。并于降压头2 h 内每15 min 监测1 次SBP,以后每小时监测其S

    心血管病学进展 2015年2期2015-02-21

  • 语言变异的种类探析
    宁大学文学院语言变异的种类探析杜启朕辽宁大学文学院语言变异是言语交际活动中一种正常的语言现象,是语言中新质要素不断出现、旧质要素不断消亡的结果。根据不同的标准,语言变异可以分为不同的种类。研究语言变异的种类,具有重要的价值和意义。语言变异;种类;模因;价值一、语言变异界说语言是社会发展的产物,在社会发展的过程中不断产生语言变异。美国著名社会语言学家威廉·拉波夫是语言变异理论的创始人,他认为语言是一个有序的异质体,是对同一事物存在的不同说法。祝畹瑾指出:“语

    科学中国人 2015年17期2015-01-28

  • 遗传算法中的变异算子的述评
    。在遗传算法中,变异算子通过模拟生物遗传和进化过程中的变异环节对个体进行变异,虽然发生变异的可能性比较的小,但也是产生新物种的一个不可忽视的原因[1]。通过变异不断在交叉算子产生的新个体的基础上进行微调、增加种群的多样性、使遗传算法在交叉算子决定的全局搜索能力的基础上还具有一定的局部搜索能力。变异算子被认为是必不可少的产生新个体的辅助方法,文献[2]认为变异算子能够成为一个重要的遗传算子,特别体现在维持种群的多样性问题上。正是变异算子在遗传算法中的不可或缺

    科技视界 2012年23期2012-08-15

  • HBV逆转录酶区181位点变异研究进展
    长,HBV易产生变异耐药,造成抗病毒治疗的失败。随着核苷(酸)类药物种类的增加,可通过联合或替代的方法挽救变异耐药,但是位于逆转录酶(reverse transcriptase,RT)区B亚区第181位氨基酸的变异给抗病毒治疗提出了一个新的“挑战”,因为其变异后不仅仅对阿德福韦产生耐药,而且对拉米夫定、恩替卡韦、替比夫定、替诺福韦的药物敏感性均呈现下降,是一个交叉核苷和核苷酸两类药物的耐药位点[3]。一、rt181变异的概念野生型HBV rt181位氨基酸

    实用肝脏病杂志 2012年5期2012-04-12

  • 消化内科6种疾病临床路径变异原因分析及措施
    例出现不同程度的变异,现分析如下。1 病例概况1.1 病例选择收集2010年3月~2011年1月符合卫生部颁布临床路径标准病例119例。其中,男性55例,女性64例;年龄25~83岁,平均年龄53.2岁;其中肠息肉 51例,急性胰腺炎29例,肝硬化腹水11例,胆总管结石取石(ERCP)27例,十二指肠溃疡1例。共完成路径例数/变异终止例数(102/17)例。其中肠息肉(47/4)例,急性胰腺炎(23/6)例,肝硬化腹水(7/4)例,胆总管结石(ERCP)取

    中国卫生质量管理 2012年5期2012-01-31

  • 踝关节MR断层解剖、解剖变异和病理——第二部分:解剖变异和病理(续)
    殷玉明Continued from last issue Bone and cartilage disorders:Clinically, acute ankle pain caused by ankle fracture and dislocation can be adequately evaluated with routine ankle radiographs. Some subtle fractures can be diff i cult t

    磁共振成像 2010年6期2010-06-02