RXRα基因遗传变异与2型糖尿病易感性的关系

2011-08-02 09:29杜文聪叶新华俞晓芳马建华成金罗高燕勤
中国老年学杂志 2011年23期
关键词:易感性脂联素多态性

叶 青 赵 旭 周 玲 陆 莹 杜文聪 李 倩 叶新华 俞晓芳 马建华 成金罗 高燕勤

(南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,江苏 南京 210029)

遗传因素在2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的发生发展中起着重要作用〔1〕,其遗传率估计为70% ~80%。脂肪组织分泌的脂联素被证实与T2DM关系密切〔2〕。人体脂联素水平除受到脂联素基因多态性本身的影响,还受到有关调控基因的影响。在脂联素编码基因ADIPOQ的启动子区,存在功能性过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)反应元件(PPRE)。PPAR-γ与视黄醛X受体α(RXRα)形成的异二聚体直接与PPRE 结合,激活脂联素基因的转录〔3~6〕。因此,RXRα 是研究T2DM的候选基因之一。此前,本课题组已对PPAR-γ基因与T2DM遗传易感性进行研究〔7〕,但RXRα基因多态性与T2DM易感性的关系未见国内外报道。本研究拟探讨RXRα基因遗传变异与江苏汉族人群T2DM遗传易感性的关系。

1 对象与方法

1.1 研究对象 2008年3月至2010年8月,在江苏省南京、常州及仪征地区的南京医科大学三所附属医院,按照1999年WHO推荐的糖尿病诊断标准,即空腹血糖≥7.0 mmol/L或口服75 mg葡萄糖后2 h血糖(OGTT)≥11.1 mmol/L以及结合糖尿病病史,共收集门诊或住院的新诊断T2DM的患者1 105例为病例组,其中男性536例,女性569例,平均年龄(57.07±11.11)岁;同时期同地区在健康体检人群中收集正常对照(无内分泌代谢性疾病史,无血缘关系)1 107例,男性516例,女性591例,平均年龄(57.02±11.40)岁,两组年龄、性别频数匹配。病例组和对照组均来自汉族人群。

1.2 调查方法 使用统一设计的调查表,分别对患者和健康对照进行流行病学调查,主要询问内容包括一般人口学特征、T2DM等慢性病病史,测量身高、体重、血压、血糖等。上述调查和采样均获得被调查者同意并签署知情同意书。调查员为本校流行病与卫生统计学专业的研究生和内分泌专科医师,经统一培训合格后,方可参加面访调查。

1.3 方法

1.3.1 实验室检测 所有受试者均空腹过夜,抽取空腹静脉血和口服75 g葡萄糖2 h后的静脉血,用全自动生化仪测定血糖、TC(总胆固醇)、TG(甘油三酯)、HDL-C(高密度脂蛋白-胆固醇)、LDL-C(低密度脂蛋白-胆固醇)。病例组所有病人均做GAD(谷氨酸脱羧酶抗体)、ICA512(胰岛细胞抗体)(英国RSI公司试剂盒)检测,以排除1型糖尿病;用PCR/Apal酶切法做线粒体基因突变〔(Trnal EU(UUR)3243A>G)〕检测,以排除线粒体基因突变型糖尿病。低温(-30℃)保存血清,采用酶联免疫吸附法(ELISA)测定血清脂联素指标。检测试剂盒购自RapidBio公司,酶标仪型号BIO-RAD Model680型。

1.3.2 基因位点的检测

1.3.2.1 RXRα基因位点的选择 采用选择潜在功能性单核苷酸(SNPs)位点的策略:以RXRα基因为研究的目的基因,从NCBI、HAPMAP等数据库以及已发表的文献中寻找和确认各基因的SNPs位点,选择在中国人群具有较高频率(MAF≥5%)并且可能影响基因功能的SNPs位点为研究靶点。确定了RXRα基因的4个 SNPs位点:rs1045570,rs4842194,rs3132291,rs4240711。探讨其与T2DM的易感性关系。

1.3.2.2 基因型检测 抽取研究对象外周血5 ml,采用酚-氯仿提取、乙醇沉淀的方法提取白细胞中的基因组DNA,并作为PCR模板。利用Real-time PCR联合 Taqman-MGB探针对RXRα基因的位点进行基因分型。按下列体系加样(5 μl体系):0.5 μl DNA 模板,2.5 μl TaqMan®Universal PCR Master Mix,0.25 μl顺式/反式引物,0.125 μl探针,1.25 μl ddH2O。反应条件:2 min 50℃、10 min 95℃,15 s 95℃,1 min 60℃,40 个循环。基因扩增的引物和探针序列见表1,利用SDS 2.0软件(ABI)观察结果。每块384孔板包括2个来自同一样本的阳性对照和2个空白样本的阴性对照。本研究中共检测2 212份DNA样本,成功率为100%,抽取其中10%样本重复检测,一致性100%。

表1 RXRα基因SNP位点基因扩增的引物和探针序列

1.4 统计学分析 采用EPIDATA3.1软件,两人双轨录入全部数据资料,核对无误后供分析使用。采用统计软件SPSS13.0进行数据的统计分析:χ2检验 、student-t检验用于分析人口学的基本特征、T2DM相关生物学指标及RXRα基因4个位点的等位基因频率在病例组和对照组的分布差异;Logistic回归分析计算OR值及95%CI;拟合优度χ2检验用于对照组基因型分布的Hardy-Weinberg平衡检验;采用LDA〔8〕软件(Linkage Disequilibrium Analyzer 1.0)分析基因连锁不平衡;运用PHASE 2.0软件根据观察到的基因型推断单倍型及其频率。

2 结果

2.1 Hardy-Weinberg遗传平衡检验 在对照组中,对RXRα基因的 4 个 SNPs位点 (rs1045570,rs4842194,rs3132291,rs4240711)三种基因型的频率进行遗传平衡检验,结果显示实际频数与理论频数分布的差别均无统计学意义(P=0.458,0.471,0.389,0.703),说明该对照组人群4个位点基因型频率分布均符合遗传平衡法则,具有人群代表性。

2.2 两组基本资料比较 病例组平均收缩压、舒张压、TG、TC、空腹血糖和脂联素水平显著高于对照组(P<0.05);HDL-C显著低于对照组(P<0.05)。两组的性别构成、平均年龄、体质指数(BMI)和LDL-C水平差异无统计学意义(P>0.05)。见表2。

2.3 单倍型分析 采用LDA软件,对上述4个位点SNPs的连锁不平衡分析显示,4个多态性位点处于低连锁不平衡(D'值0.1~0.8)。RXRα基因4个潜在功能性位点(顺序依次为rs1045570,rs3132291,rs4240711,rs4842194)构成的 4 种主要单倍型中,与最常见的单倍型GTAT相比,单倍型TTAT(含变异等位基因rs1045570T)可显著降低T2DM的患病风险〔调整OR(95%CI)=0.868(0.801~0.940)〕。见表3。

表2 两组基本资料比较(±s)

表2 两组基本资料比较(±s)

变量 病例组(n=1 105) 对照组(n=1 107) P值男/女(n)536/569 516/591 0.372年龄(岁) 57.07±11.11 57.02±11.40 0.380收缩压(mmHg) 137.99±20.56 127.93±18.13 <0.001舒张压(mmHg) 85.02±11.80 79.35±10.42 0.002 BMI(kg/m2) 24.88±3.55 24.15±3.27 0.069 HDL-C(mmol/L) 1.14±0.46 1.42±0.37 0.017 LDL-C(mmol/L) 2.82±0.96 2.57±0.89 0.062 TC(mmol/L) 5.16±1.37 5.04±0.95 <0.001 TG(mmol/L) 2.62±2.75 1.60±1.04 <0.001空腹血糖(mmol/L) 10.91±3.94 5.08±0.53 <0.001脂联素(mg/L)6.23±1.74 7.14±2.62 <0.001

表3 RXRα基因潜在功能性SNPs单倍型与T2DM易感性的关系

2.4 RXRα基因在病例组和对照组的基因型分布及其比较RXRα基因4个位点基因型和等位基因频率在两组间的分布无显著差异(均P>0.05)。在调整性别、年龄和BMI等因素后,仍未发现4个位点与T2DM易感性存在统计学关联。见表4。

表4 RXRα基因多态性与T2DM易感性分析〔n(%)〕

3 讨论

RXRα是甲状腺/类固醇受体家族中的一种普通DNA结合受体。RXRα可被内源性激动剂9-顺式视磺酸激活,同样能激活 PPAR:RXR 复合物〔9〕。Metzger〔10〕等通过动物实验发现RXRα基因的表达在脂肪生成及肥大过程中起重要作用。此外,Wan〔11〕等研究发现缺乏肝脏RXRα的小鼠摄食量减少,增加体重以及改善糖耐受。Imai〔12〕和 Yang〔13〕都发现 RXRα 在肝细胞的增殖和生长过程中起重要作用。因此,有必要进行人群RXRα基因多态性与T2DM易感性的关联研究。本课题组采用病例对照研究,探讨中国南方汉族人群RXRα基因标签位点(另已报道)〔7〕和潜在功能性位点SNPs多态性与T2DM的关联性。本文4个潜在功能性位点等位基因频率与NCBI中中国人群的数据均相接近。经多因素回归分析调整年龄、性别及BMI后,4个位点均未发现与T2DM易感性存在统计学关联。

由RXRα基因的4个潜在功能性位点构成的单倍型分析中,发现单倍型TTAT(含变异等位基因 rs1045570T)较最常见的单倍型GTAT可显著降低T2DM的患病风险。推测变异等位基因rs1045570 T可能需要其他多态位点协同而发挥作用,存在位点-位点间的交互作用。本文样本人群中携带危险单倍型GTAT者达到50%以上,从这个角度而言,这些单倍型携带者是T2DM高危人群,更要避免和减少暴露肥胖等环境危险因素,应该强调通过科学的生活方式,包括合理膳食及坚持体育锻炼等,控制体重在正常水平,以预防和延缓T2DM的发生。值得指出的是本研究的阶段性资料(病例520例,对照550例)中,由于病例和对照组TTAT单倍型频率均很低,因此未显示该单倍型在两组的频率分布显著差异。同时,其他单倍型或有与本文相反结果。本文通过大样本的病例对照研究,一方面可以减少样本含量偏小可能造成的假阳性或假阴性错误,另一方面可以发现与T2DM易感性相关的突变频率相对较低的RXRα基因单核苷酸遗传变异位点,从而更客观地评价RXRα基因多态性在T2DM发生发展中的作用。

鉴于病例对照研究设计很难避免样本人群的偏倚问题,本文有关TTAT单倍型可降低T2DM发病风险的发现,有必要在其他人群中进一步验证,并进而通过功能实验得以确定。

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