荧光PCR技术在ICU抗菌药物使用患者中检测真菌感染的临床意义

2017-11-22 08:15刘东育赵洪伟马庆庆
临床检验杂志(电子版) 2017年2期
关键词:假丝念珠菌酵母菌

刘东育,赵洪伟,马庆庆

(1.贵州航天医院重症医学科;2.中心实验室,贵州 遵义 563000)

荧光PCR技术在ICU抗菌药物使用患者中检测真菌感染的临床意义

刘东育1,赵洪伟1,马庆庆2

(1.贵州航天医院重症医学科;2.中心实验室,贵州 遵义 563000)

目的分析比较聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)法与传统培养法在重症加强护理病房(intensive care unit,ICU)抗菌药物使用患者中检测真菌感染的临床意义。方法我院使用多种抗菌药物的患者,取痰液60份,血液30份。将每例标本采集两份,一份真菌培养,另一份冻箱保存,到一定数量后用PCR方法检测真菌。结果在90份临床标本中,二种方法均检测出白色念珠菌、 热带假丝酵母菌、光滑假丝酵母菌,以白色念珠菌为多。二种方法对念珠菌所检出率无显著性差异。结论PCR检测疑似菌感染临床标本具有快速简便,稳定性好、敏感性和特异性均较理想的特点,值得临床实验室推广使用。

聚合酶链式反应;假丝酵母菌属;真菌

真菌是医院感染常见的病原菌,传统的培养法时间长、灵敏度低,聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)法能快速、直接地检测标本中感染的真菌,可以作为早期快速诊断的工具[1,2]。与一般细菌感染患者相比,假丝酵母菌属感染患者的预后较差,因此有必要开发一种迅捷、准确的检测方法[3]。本研究通过比较PCR检测方法与传统培养法的诊断敏感性与准确性,旨在更早鉴定所感染的真菌,指导临床合理用药,提高抗真菌的治疗效果。

1 材料与方法

1.1 临床标本 收集2013年1月-2017年1月,我院在ICU中使用多种抗菌药物,如:头孢类药物、喹诺酮类药、亚胺培兰-西司他丁钠等或联合用药的90例患者,治疗7天后仍持续发热,临床疑似真菌感染的病例标本:痰液60份,血液30份。90份标本中,男性52例,女性38例;平均年龄65岁;同一标本检测出2种或≥3种菌株时,仅选用优势菌株。

1.2 传统培养及科玛嘉显色鉴定 将临床样本接种于萨布罗培养基(天津市金章科技发展有限公司)中进行培养,涂片镜检为真菌后接种至科玛嘉(郑州博赛生物技术股份有限公司)假丝酵母菌显色培养基(CHROMA-gar)中进行培养,假丝酵母菌属类别根据菌落颜色的变化进行鉴定。白色假丝酵母菌为翠绿色,热带假丝酵母菌为蓝灰色,克柔假丝酵母菌为粉红色,光滑假丝酵母菌为紫色,其他假丝酵母菌为白色(如近平滑假丝酵母菌等)。

1.3 真菌基因提取及PCR扩增 待检标本的真菌DNA用Biospin真菌基因组DNA提取试剂盒提取。根据假丝酵母菌IST1、ITS2及拓扑异构酶II的序列设计的不同种类的特异性引物,引物均由生工生物工程(上海)有限公司代为合成。以提取的基因组DNA为模板,采用以下试验体系和程序进行PCR扩增,PCR反应体系(终浓度):1×PCR缓冲液液(含MgCL2),上、下游引物各0.2 μmol/L,dNTP 0.2 mmol/L,DNA模板,2.5 U TaqDNA聚合酶,灭菌ddH2O补至50 μL。扩增程序:94oC预变性3 min、94oC变性30 s、58oC退火1 min、72oC延伸1 min,30个循环、72oC延伸10 min。扩增完毕后,将PCR扩增产物在1%琼脂糖凝胶(含EB 0.5 μg/mL)中进行电泳,在Bio-Rad凝胶成像分析系统上进行分析、摄相,根据扩增片段大小来判断假丝酵母菌的型别。每次PCR试验整个过程需严格控制污染,均需设置空白对照(模板DNA用ddH2O代替)及阳性对照。

1.4 统计学方法 采用SPSS 19.0统计软件分析所得数据,计数资料采用率(%)表示,组间比较采用χ2检验,P<0.05为差异有统计学差异。

2 结果

2.1 假丝酵母菌属的阳性率及标本来源分布 经传统的萨布罗培养基培养并镜检后,90份疑似真菌感染的标本中真菌感染28份,阳性率为31.11%。见表1。

表1 PCR法与传统真菌培养法检测标本结果

2.2 PCR方法对临床标本的检测 经PCR检测发现,90份标本中阳性31份,阳性率为34.44%,其中白色假丝酵母菌、热带假丝酵母菌、光滑假丝酵母菌分别检出21株、3株、1株。见图1。

图1 真菌基因提取及PCR扩增结果。M:Marker。内控:人固有基因组作为内控。5、6、7、8、10、11、12、16、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、32:白色念珠菌。1、4、31:热带假丝酵母菌。30:光滑假丝酵母菌。

2.3 PCR与传统培养法的比较 两种方法对念珠菌所检出率无显著性差异,检测一致性较好。

3 讨论

本研究通过两种不同的方法对90份疑似真菌感染标本进行检测发现,PCR法与传统萨布罗培养及科玛嘉假丝酵母菌显色法相比,对念珠菌的检出率无统计学差异,说明检测的一致性较好,但PCR法1个工作日即可出结果,提高了检测效率,缩短检测时间。可见,PCR法具备方便、快速诊断等特点[3]。本研究所收集的疑似标本主要为痰液(其中痰液60份,血液30份),通过对这些感染标本进行PCR法及传统假丝酵母菌数培养法的鉴定发现,最常见的真菌是白色假丝酵母菌,其次为热带假丝酵母菌、光滑假丝酵母菌,与以往报道结果一致。

PCR是一种可快速诊断细菌或真菌感染的实验室方法[4]。实验的全过程要严格按照相关要求进行操作,并要求设计相关的空白和阳性对照,以便最大限度地保证试验的准确性。随着大剂量、长时间抗菌药物的使用导致真菌感染的几率加大,患者死亡率增加[5]。PCR检测作为深部真菌感染的诊断方法更为快速、简洁、敏感、准确。

综上,PCR检测疑似菌感染临床标本具有快速简便,稳定性好、敏感性和特异性均较理想的特点,值得临床实验室推广使用。

[1]Czurda S,Lion T.Broad-spectrum molecular detection of fungal nucleic acids by PCR-Based amplification techniques.Human Fungal Pathogen Identification: Methods and Protocols,2017: 257-266.

[2]Avni T,Leibovici L,Paul M.PCR diagnosis of invasive candidiasis: systematic review andmeta-analysis [J].J Clin Microbiol,2011,49(2): 665-670.

[3]Luo G,Mitchell TG.Rapid identification of pathogenic fungi directly from cultures by using multiplex PCR [J].J Clin Microbiol,2002,40(8): 2860-2865.

[4]Lau A,Sorrell T C,Chen S,et al.Multiplex tandem PCR: a novel platform for rapid detection and identification of fungal pathogens from blood culture specimens [J].J Clin Microbiol,2008,46(9): 3021-3027.

[5]黄燕,陈玉坤,冀旭峰,等.ICU患者深部真菌感染的病原菌分布及耐药性分析[J].吉林大学学报(医学版),2017,43(1): 111-114.

猜你喜欢
假丝念珠菌酵母菌
米卡芬净对光滑假丝酵母菌在巨噬细胞内活性的影响
为什么酵母菌既能做面包也能酿酒?
PCR-RFLP在VVC相关念珠菌菌种鉴定中的应用
酵母菌及其衍生物在水产养殖中的研究与应用
郫县豆瓣中一株耐盐酵母菌的分离鉴定及其发酵性能
念珠菌耐药机制研究进展
中西医结合治疗复发性外阴阴道假丝酵母菌病的临床观察
临产孕妇念珠菌感染及不良妊娠结局调查
妇炎消胶囊联合舒康凝胶治疗复杂性假丝酵母菌阴道炎100例
PCR-RFLP鉴定常见致病性念珠菌