焦化厂区地肤根际芘降解细菌筛选和促生潜力研究

2017-12-07 10:33宋立超钮旭光赵浩宇周立炀
农业环境科学学报 2017年11期
关键词:脱氨酶焦化厂根际

宋立超,张 薇,钮旭光,李 瑞,曹 阳,赵浩宇,周立炀

焦化厂区地肤根际芘降解细菌筛选和促生潜力研究

宋立超,张 薇,钮旭光,李 瑞,曹 阳,赵浩宇,周立炀

(沈阳农业大学土地与环境学院,沈阳 110866)

为强化焦化厂土壤多环芳烃原位植物-微生物修复的应用,提供具有降解多环芳烃功能的植物促生菌,分别以芘和1-氨基环丙烷-1-脱氨酶(ACC脱氨酶)为唯一碳源和氮源,采用富集培养法对某焦化厂优势植物地肤根际土壤中的功能菌株进行分离。研究分离的菌株对芘的降解能力和对植物的促生特性;通过种子萌发试验,以芘为碳源,研究菌株对地肤种子发芽率和根长的影响。多次富集后,得到7株菌,经鉴定命名为考克氏菌KSB1、芽孢杆菌KSB2、类香味菌KSB3、沙雷菌KSB4、副球菌KSB5、松鼠葡萄球菌KSB6、芽孢杆菌KSB7。经过14 d的降解实验,菌株KSB1、KSB2、KSB4、KSB5和KSB7均可降解约58%以上的芘。菌株KSB2、KSB4和KSB7的ACC脱氨酶活性大于3.5 M α-KB·mg-1·h-1。在种子萌发实验中,菌株KSB2、KSB4和KSB7均可显著提高芘胁迫下(芘浓度10~25 mg·L-1)地肤种子的发芽率和芽长,其中KSB7的效果最好,与对照相比对地肤发芽率和芽长分别提高了56.76%和88.9%,表明菌株KSB7在焦化厂污染土壤的地肤-微生物联合修复中具有较大的应用潜力。

根际促生菌;地肤;多环芳烃;降解

多环芳烃(Polycyclic Aromatic Hydrocarbons,PAHs)是环境中普遍存在的一类持久性有机污染物,给人类健康和生态环境造成了严重的危害[1-2],它是焦化厂污染土壤中的主要污染物之一,主要来源于炼焦过程中煤的不完全燃烧[3]。李凤梅等[4]报道沈阳某焦化厂土壤中13种PAHs质量浓度总和为5 672.00 mg·kg-1,且以4环和5环为主,占PAHs总和的75.21%。冯嫣等[5]报道北京某焦化厂车间土壤中PAHs质量浓度为144.81 mg·kg-1,以3环和4环为主。近年,由于环境污染和城市规划等原因,一些市中心的焦化厂开始搬迁,而遗留的场地将被改为居住和商业用地。因此,如何有效地清除或降低焦化厂地PAHs污染风险便成为人们重点关注的问题。

针对焦化厂目前已有的PAHs修复技术包括化学淋洗、化学氧化、电动修复、微生物修复和植物修复等[6]。其中微生物修复和植物修复方法由于低耗、经济有效且环境友好等特点,已成为目前污染土壤修复的主要方式[7-8]。Sun等[9]从焦化厂土壤筛选分离出菌株Kocuria sp.P10,液体培养14 d对芴、荧蒽和芘的降解率分别为83.2%、76.5%和59.6%。但由于游离降解菌难于在土壤中存活,导致单纯的微生物修复技术难以大面积推广。Smith等[10]选取了高羊茅、紫羊茅、黑麦草、红车轴草和三叶草分别修复焦化厂污染的土壤,结果表明植物对3环和4环的PAHs具有一定的修复能力。但由于PAHs具有一定的毒性,可影响植物的生长,致使单纯通过植物修复的效率并不高,如何提高植物对PAHs毒性的抗性、提高植物的生物量、降低PAHs的浓度成为提高植物修复效率的重要途径[11]。微生物和植物联合修复技术可弥补各自缺点,微生物可部分降解PAHs,降低土壤PAHs的浓度,减轻PAHs对植物的毒害,而植物的根际区可为共生菌提供良好的生长环境,利于菌株的存活,此外根际共生菌往往还具有促生功能,能够提高植物的生物量[12-13]。Guo等[12]向农田污染土壤中添加降解PAHs的分枝杆菌,可提高黑麦草对PAHs的去除率和土壤中降解PAHs功能微生物的数量。然而,目前关于焦化厂原位优势植物根际区专性降解PAHs促生菌的研究还未见报道。

笔者对沈阳某弃用焦化厂土壤PAHs进行检测,结果表明4环芘的含量最高,占PAHs总量的15.11%,故该试验选择芘为PAHs的代表模型。利用富集法,从焦化厂区优势植物地肤根际分离具芘降解能力的促生菌,研究它们的促生潜能、降解芘的能力以及对地肤种子生长的影响,以期为焦化厂土壤PAHs污染植物-微生物修复提供理论依据。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 主要试剂

芘(纯度>97%)购自Fluka公司;1-氨基环丙烷-1-脱氨酶(1-amino cyclopropane-1-deaminase,ACC)、吲哚乙酸(Indoleacetic Acid,IAA)购自华中海威(北京)基因科技有限公司。

1.1.2 主要培养基

①液体无机盐培养基(g·L-1):MgSO4·7H2O 0.2,K2HPO40.8,(NH4)2SO41.0,KH2PO40.2,NaCl 20.0,CaCl2·2H2O 0.1,葡萄糖 0.05,调节 pH 至 8.0。

②DF 盐培养基(g·L-1):葡萄糖 2.0,(NH4)2SO42.0,Na2HPO46.0,MgSO4·7H2O 0.2,KH2PO44.0,葡萄糖酸2.0,柠檬酸2.0,调节pH至8.0。

③ADF培养基:用ACC替代DF培养基中(NH4)2SO4,将ACC溶于灭菌蒸馏水后,再过0.22 μm有机滤膜除菌,使其最终浓度为3.0 mmol·L-1。

④PKO培养基(g·L-1):Ca3(PO4)25.0,葡萄糖5.0,NaCl 20.0,KCl 0.3,(NH4)2SO40.5,MnSO4·4H2O 0.03,MgSO4·7H2O 0.3,FeSO4·7H2O 0.03,琼脂 20.0,调节pH至8.0。

1.1.3 土样的采集及理化性质测定

2016年7月,在沈阳某弃用焦化厂区外(41°48′N,123°20′E)采集生长优势植物地肤,采用五点采样法取样,每点掘出面积为10 cm×10 cm,深度为10 cm的包含地肤根系的整块土壤样本,实验室无菌条件下将根际和非根际土壤刮下备用,于4℃冰箱保存。测定土壤有机质、pH值、速效N、速效P、速效K以及土壤和地肤中16种PAHs含量。16种PAHs的测定参考Khan等[14]的方法。PAHs的方法检出限为0.021~0.103 mg·kg-1(干重),土壤基质加标回收率为84.21%~108.36%。

1.2 根际土壤中具促生能力的芘降解细菌的筛选

取5 g地肤根际土加入到45 mL液体无机盐培养基中(含芘浓度为 25 mg·L-1),28 ℃、120 r·min-1振荡培养7 d;取上述培养液5 mL再次加入到45 mL含芘的液体无机盐培养基中,28℃、120 r·min-1培养7 d,重复3次,稀释平板法LB固体培养基计数芘耐受菌的数量。

吸取1 mL上述富集液加入到30 mL DF盐培养基中,28 ℃、120 r·min-1振荡培养 24 h,按上述方法再次转接1 mL至30 mL的ADF液体培养基中,28℃、120 r·min-1培养 24 h,重复 3次,通过ADF固体培养基进行稀释分离单菌落。

1.3 芘降解细菌的鉴定

利用细菌 16S rRNA 通用引物(F27:5′-AGAGTT TGATCMTGGCTCAG-3′,R1492:5′-TACGYTACCTT GTTACGACT-3′)序列进行PCR扩增,具体参照宋立超等[15]的方法。获得产物进行测序,然后将所测得序列在GenBank中进行比对。同时常规方法对分离菌的形态、革兰氏染色、芽孢以及菌落特征进行分析。

1.4 分离细菌的特点

1.4.1 促生特性测定

所分离菌株的ACC脱氨酶活性测定参照Liu等[16]的方法,解磷能力参照张国壮等[17]的方法,产物IAA的检测采用Salkowski方法[18],产铁载体能力参照Payne的[19]方法。

1.4.2 分离菌种的降解特征

以浓度108CFU·mL-1的投菌量和含芘25 mg·L-1液体无机盐培养基为基础,分别投加所筛选细菌,以不加任何菌株作为对照,28℃、120 r·min-1恒温振荡培养,分别在7 d和14 d取样分析芘残留量。每个处理设3次重复。溶液中芘的萃取参照宋立超等[15]的方法,芘的测定采用液相色谱法。

1.5 芘胁迫下菌株对地肤种子的促生能力

地肤种子的前处理参照Liu等[13]的方法,先将地肤种子用70%的酒精表面消毒2 min,然后再用1%次氯酸钠消毒10 min,最后用无菌水冲洗3遍,20粒消毒后的种子放入铺有两层滤纸的培养皿中,分别添加不同浓度的芘溶液(0、10、25 mg·L-1)和 1 mL 的菌悬液(OD600nm=0.6~0.8),28℃ 培养 5 d,测定种子的发芽率和芽长。

1.6 统计分析

统计分析使用SPSS 16.0,样品均值的比较采用LSD检验(α=0.05),数据处理使用软件Origin 8.1。

2 结果与分析

2.1 供试土壤性质

地肤根际和非根际土壤理化性质见表1,可见该地区土壤为弱碱性,地肤根际区的有机质、速效N、速效P和速效K均显著高于非根际区。根际区PAHs质量浓度与非根际区相比,减少了25.1 mg·kg-1,而地肤中PAHs浓度却为7.69 mg·kg-1,且根际区含有大量的PAHs耐受菌,这部分菌株具有降解PAHs的潜能,表明地肤根际区PAHs的去除可能是由植物累积和微生物降解协同作用完成。

2.2 分离菌株的鉴定

以芘和AAC为唯一碳源和氮源从地肤根际富集分离出可培养细菌7株,分别编号为KSB1、KSB2、KSB3、KSB4、KSB5、KSB6 和 KSB7,其菌落形态及鉴定结果列于表2。菌株KSB2和KSB7均为芽孢杆菌属,长杆、有芽孢、革兰氏染色为阳性、白色菌落;KSB4为沙雷氏菌,短杆、革兰氏染色阴性、白色菌落。

2.3 分离菌株的促生特性

分离菌株促生特性结果列于表3,除了菌株KSB3和KSB6以外,其余5株菌ACC脱氨酶活性均大于 1.0 M α-丁酮酸 mg-1·h-1(M α-KB mg-1·h-1),其中菌株KSB2、KSB4和KSB7的ACC脱氨酶活性在3.55~5.21 M α-KB mg-1·h-1;7 株菌均具有产 IAA 的能力,范围为6.33~108.71 mg·L-1;铁载体为定性检测,菌株KSB3能力最强;菌株KSB2和KSB5不具溶磷特性,菌株KSB7溶磷效果最好。综上,除了铁载体以外,在所有菌株中KSB7具有最高水平的ACC脱氨酶、IAA产物和溶磷活性。

2.4 分离菌株对芘的降解特征

筛选分离所得7株细菌,经14 d培养后其对芘降解效果如图1所示。各菌株对芘均具有一定的降解能力,其中菌株KSB2和KSB5对芘的降解启动速率较快,在培养7 d后对芘的降解率分别为35.81%和38.57%,然而菌株KSB7在14 d后对芘的降解率却最高,达到90.23%,表明在根际区菌株KSB2和KSB5可能对芘的降解起先导作用,作为共代谢底物促进菌株KSB7对芘的降解,进而提高根际区对PAHs的降解效率。

表1 供试土壤主要理化性质Table 1 Characteristics of experimental soil

表2 分离菌株的鉴定Table 2 Identification of isolates

表3 分离菌株的促生特点Table 3 PGP features of isolated strains

2.5 不同芘浓度下菌株对地肤种子的影响

图1 各菌株对芘的降解效果Figure 1 Biodegradation rate of pyrene by strains

综合上述菌株的促生特性和对芘的降解能力,选取菌株KSB2、KSB4和KSB7,考察它们对地肤种子的促生能力。经过5 d培养后其对种子发芽率和芽长的影响如表4所示。不添加任何菌时,发芽率和芽长随着芘浓度的增加而降低;接种后,无芘胁迫下各菌株与CK相比促生能力无显著差别,而伴随着芘浓度的增加,它们则可显著提高地肤的发芽率和芽长;菌株KSB7表现出最好的促生能力,与CK相比10 mg·L-1芘胁迫下发芽率和芽长分别提高了14.74%和50%,25 mg·L-1芘胁迫下提高了56.76%和88.9%(KSB7-CK/CK),表明菌株KSB7对高浓度芘胁迫下的地肤种子的萌发和生长具有显著的影响。

表4 不同芘浓度下菌株对地肤种子生长的影响Table 4 Effects of strains on the growth of Kochia scoparia grown in different concentrations pyrene

3 讨论

目前,国内外研究者主要通过添加功能微生物(根际促生菌、PAHs降解菌株)来强化植物对PAHs类有机污染物的吸收降解作用[20]。Liu等[13]在石油污染土壤高羊茅根际筛选出1株具促生能力的Klebsiella sp.D5A,接种后高羊茅对石油烃的降解率提高了16.2%,地上和地下生物量各提高了75.2%和42.2%。刘魏魏等[11]研究表明接种PAHs专性降解菌可使紫花苜蓿对PAHs的降解率提高49.6%,而同时接种植物促生菌和PAHs专性降解菌时紫花苜蓿对PAHs的降解率提高了60.1%。基于此,利用降解PAHs的促生菌联合植物修复PAHs污染的焦化厂具有一定的应用潜力,植物和共生功能菌株的筛选是关键。地肤对环境适应性强,土壤生长范围广,具有一定耐碱特性,Moubasher等[21]研究表明地肤能有效去除干旱地区土壤中石油烃,去除率为31.2%~57.7%,但有关其根际细菌与地肤联合修复有机污染的研究还未见报道。本研究从PAHs污染焦化厂地肤根际分离筛选出7株具芘降解特性的促生菌株,研究了菌株对芘的降解能力。结果表明,摇床培养14 d后菌株KSB1、KSB2、KSB4、KSB5 和 KSB7 对芘的降解率均在58%以上(芘25 mg·L-1)。分离菌株经鉴定分别属于考克氏菌属(Kocuria sp.)、芽孢杆菌属(Bacillus sp.)、类香味菌属(Myroides sp.)、沙雷菌属(Serratia.Sp.)、副球菌属(Paracoccus sp.)、松鼠葡萄球菌属(Staphylococcus sciuri)和芽孢杆菌属(Bacillus sp.)。KSB2、KSB4、KSB5和KSB7所在属的菌株具有降解PAHs的功能已有报道,系统发育分析与KSB2亲缘关系较近的菌株Bacillus sp.SPL-4可去除土壤中35.1%的4环PAHs,53.5%的5环和6环PAHs[22],且有多个研究表明该属菌可产生生物表面活性剂[22-23]。本研究中菌株KSB2培养7 d对芘的降解率最高,表明该属菌株是一类降解PAHs的优势菌群。Liu等[24]研究表明接种菌株Bacillus sp.DZ13可提高花生植株13.8%的生物量。本研究发现菌株KSB2、KSB4和KSB7的ACC脱氨酶活性大于 3.5 M α-KB mg-1·h-1,7 株菌均具有产IAA的能力,范围为6.33~108.71 mg·L-1,具有较强的促生潜力。

根际促生菌可提高种子的发芽率和芽长,进而提高植株的生物量。但植物对所分离的功能菌株是否具有根际效应,是菌株发挥功能的关键。Chen等[25]发现接种Microbacterium sp.KL5和Candida tropicalis C10可提高黑麦草和东南景天的生物量和对PAHs的去除率,但黑麦草与东南景天比,具有较好的根际效应。为此,我们在促生特性和芘降解能力实验的基础上,选取菌株KSB2、KSB4和KSB7,做了促生试验,结果表明无芘胁迫下菌株的促生特性与对照相比无显著差别,然而随着芘浓度的升高,显著增加了地肤的发芽率和芽长(表4)。菌株KSB7在芘胁迫下表现出了良好的促生能力,浓度25 mg·L-1与10 mg·L-1相比,其促生功能所发挥的相对作用更强,表明菌株KSB7在污染胁迫下,降解功能起先导作用,先缓解了高浓度芘对种子的毒害作用,进而达到促生的效果。关于菌株KSB7对土壤PAHs地肤修复的影响在今后工作中将做进一步的研究。

4 结论

本研究从焦化厂优势植物地肤根际土壤筛选分离出7株具PAHs降解能力的根际促生菌,其中菌株KSB7具有较高的芘降解能力和促生活性,鉴定属于芽孢杆菌属(Bacillus sp.),接种该株菌可显著提高地肤种子对芘的抗性,在25 mg·L-1芘浓度下,与对照相比地肤发芽率和芽长分别提高了56.76%和88.9%。表明菌株KSB7在焦化厂污染土壤的地肤-微生物联合修复中具有较大的应用潜力。

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Screening of pyrene-degrading bacteria from Kochia scoparia rhizosphere in coking plant and study of plant growth-promoting ability

SONG Li-chao,ZHANG Wei,NIU Xu-guang,LI Rui,CAO Yang,ZHAO Hao-yu,ZHOU Li-yang
(College of Land and Environment,Shenyang Agricultural University,Shenyang 110866,China)

In order to enhance in situ bioremediation of coking plant soils contaminated by polycyclic aromatic hydrocarbons(PAHs)and obtain plant growth-promoting bacteria that can degrade PAHs,functional strains in the rhizosphere of Kochia scoparia,which is a typical plant in coking plants,were obtained using the enrichment culture method.Pyrene and 1-amino cyclopropane-1-deaminase(ACC)were used as the sole carbon and nitrogen sources,respectively.The pyrene degradation ability and plant growth-promoting characteristics of the isolated strains were studied.The effect of the strains on the germination rate and root length of Kochia scoparia seeds were also analyzed using pyrene as the carbon source.After several enrichment times,7 strains were identified and named as Kocuria sp.KSB1,Bacillus sp.KSB2,Myroides sp.KSB3,Serratia.sp.KSB4,Paracoccus sp.KSB5,Staphylococcus sciuri.KSB6,and Bacillus sp.KSB7.In the degradation experiment,more than 58%of pyrene could be degraded in 14 days by strains KSB1,KSB2,KSB4,KSB5,and KSB7.The activity of ACC deaminase was more than 3.5 M α-KB mg-1·h-1in KSB2,KSB4,and KSB7.Strains KSB2,KSB4,and KSB7 significantly improved the germination rate and root length under pyrene stresses of 10~25 mg·L-1.Compared to CK,KSB7 increased the germination rate by 56.76%and shoot length by 88.9%,respectively.The results show that strain KSB7 has great potential in the bioremediation of contaminated soils of coking plants using Kochia scoparia.

plant growth-promoting rhizobacteria;Kochia scoparia;polycyclic aromatic hydrocarbons;degradation

X171.5

A

1672-2043(2017)11-2275-06

10.11654/jaes.2017-0997

宋立超,张 薇,钮旭光,等.焦化厂区地肤根际芘降解细菌筛选和促生潜力研究[J].农业环境科学学报,2017,36(11):2275-2280.

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2017-07-17 录用日期:2017-10-16

宋立超(1979—),女,辽宁沈阳人,博士,讲师,从事土壤有机污染生物修复方面的研究。E-mail:slch_1979@163.com

国家自然科学基金项目(41703103,31401322);农业部东北耕地保育重点实验室项目(2015NYBKFT-4)

Project supported:The National Natural Science Foundation of China(41703103,31401322);Laboratory of Northeast Arable Land Conservation of Ministry of Agriculture(2015NYBKFT-4)

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