日前,南京农业大学园艺学院教授张绍铃团队系统鉴定了141种植物基因组中不同类型重复基因,构建了世界首个植物重复基因数据库,揭示重复基因进化的普遍规律。
以往研究发现,有的植物有复制自己基因的功能,即通过不同类型复制方式产生一个与原基因序列相同的新基因。基因复制产生的两个同源基因称为重复基因或“姊妹基因”。近年来,越来越多的植物基因组被破译,目前已经完成全基因组测序的植物超过200种,但仍缺乏一个具有广泛适用性的鉴定不同种类植物重复基因的方法。
该团队通过大规模收集整合国内外植物基因组数据资源,构建了世界首个植物重复基因数据库,目前已收录141种完成基因组测序的植物,包含大豆、水稻、小麦、玉米等大宗粮食作物,以及梨、桃、葡萄、蔬菜、花卉等园艺作物,并将拓展为植物相关的所有类别。该数据库将为深入研究重复基因的进化机制提供宝贵的数据资源。