急性缺血性卒中患者血清miRNA-148a表达水平检测及其临床价值预探索

2019-12-31 02:05郭桂珍韩荣胜王有清刘庆春
中国卒中杂志 2019年11期
关键词:外周血缺血性脑梗死

郭桂珍,韩荣胜,王有清,刘庆春

急性缺血性卒中(acute ischemic stroke,AIS)是神经内科最常见的危重症之一,其致死率和致残率均较高[1]。据统计数据显示,我国每年新增卒中患者近200万例,其中接近80%为缺血性卒中[2-3]。因此,进一步探讨AIS可能的分子标志物显得十分重要。微小RNA(microRNA,miRNA)是一类长度为19~25 bp的小分子RNA,可在转录后水平对基因表达进行负调控,从而参与细胞增殖、分化、凋亡等多种生物学过程[4]。miRNA-148a定位于7号染色体7p15.2,与炎症免疫性疾病和肿瘤的发生发展密切相关[5]。近期研究也发现,miRNA-148a可调节组织的缺血预适应损伤,并与创伤性脑损害的病理过程有关[6-7]。然而,关于miRNA-148a在AIS中的表达水平及临床价值尚未见报道。本研究通过分析AIS患者外周血血清的miRNA-148a水平及临床资料,以探讨miRNA-148a在AIS发病和病情评估方面的潜在价值;同时,运用生物信息学方法预测miRNA-148a可能的调节机制,为后续研究提供理论基础。

1 研究对象与方法

1.1 研究对象 本研究为前瞻性研究,选取2017年10月-2018年4月青海省第五人民医院神经内科收治的AIS患者42例为观察组,其中男性25例,女性17例,平均年龄62.4±9.3岁。纳入标准:①年龄40~85岁,首次发病且发病至入院时间<12 h;②AIS的诊断符合2014年中国急性缺血性卒中诊治指南[3]。排除标准:①合并出血性卒中、颅内血管畸形等神经系统疾病;②合并心绞痛、心肌梗死、感染、炎症免疫性疾病、恶性肿瘤、血液病等;③严重心力衰竭、严重肝肾功能不全者;④近期口服免疫抑制剂、糖皮质激素或细胞毒性药物。选取于本院体检中心接受体检且确定无全身疾病者42例为健康对照组,根据年龄和性别与观察组进行1∶1匹配。本研究经医院伦理委员会批准,所有研究对象均知情同意。

1.2 资料收集 收集年龄、性别、高血压史、糖尿病史、吸烟史等基本临床资料,记录AIS患者发病至入院的时间,并根据颅内MRI结果计算梗死灶最大层面直径。其中,直径<1.5 cm为腔隙性脑梗死,1.5~5.0 cm为中等面积脑梗死,>5.0 cm为大面积脑梗死[8]。收集患者生化指标检测结果,包括LDL-C、HDL-C、入院血糖、Cr、hs-CRP等。

所有研究对象至医院后即刻抽取其肘静脉血5 mL于非抗凝管中,3000 g×15 min离心,取上清液分装于离心管中并储存于-80 ℃冰箱,以便统一检测miRNA-148a水平。采用Trizol裂解液提取血清样本的总RNA,RNA反转录合成cDNA。然后以cDNA为模板采用实时定量聚合酶链反应技术进行基因片段扩增,仪器为Bio-Rad iQ5实时荧光定量聚合酶链反应仪。其中,miRNA-148a的上游引物序列为5'-TCAGTGCACTACAGAACTTTGT-3',下游引物序列为5'-GCTGTCAACGATACGCT ACGT-3'。U6核小分子RNA作为内参基因,其上游引物序列为5'-CGCTTCGGCAGCACAT ATA-3',下游引物序列为5'-TTCACGAAT TTGCGTGTCAT-3'。反应条件为:95 ℃预变性30 s,40个循环(95 ℃ 5 s、60 ℃ 30 s、72 ℃ 30 s)。miRNA-148a的相对表达量采用2-ΔΔCt法计算。

1.3 公共数据分析 从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)(https:// www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)下载数据集GSE55937[9]。该数据集共收集24例AIS患者和24例健康对照者的外周血样本,采用Affymetrix公司的Multispecies miRNA-3 Array芯片进行检测,平台号为GPL16384。下载数据为CEL格式,采用R软件的affy包进行背景校正、数据标准化和log2转换后用于后续分析。

1.4 生物信息学分析 采用miRDB、miRTar Base和TargetScan数据库分别对miRNA-148a的靶基因进行预测,其结果取交集后得到最终的靶基因。采用Cytoscape 3.6.0软件构建miRNA-148a的靶基因调控网络。然后,利用DAVID 6.8在线工具对靶基因进行富集分析,包括基因本体论(gene ontology,GO)-生物学过程、京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路,其结果用超几何分布进行统计学检测。

1.5 统计学方法 采用GraphPad 6.0软件进行统计学分析。采用Kolmogorov-Smirnov法进行正态检测,所有计量资料均符合正态分布,用表示,其组间比较采用独立样本t检验。计数资料用频数(%)表示,其组间比较采用χ2检验。采用Spearman相关性检验分析miRNA-148a水平与AIS患者临床资料之间的关系。绘制miRNA-148a对AIS诊断的受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线,以曲线下面积反映其诊断效能。P<0.05为差异具有统计学意义。

2 结果

2.1 miRNA-148a在急性缺血性卒中患者中的表达 AIS组患者入院时的血清miRNA-148a相对表达量为0.76±0.23,而健康对照组的miRNA-148a相对表达量为1.02±0.21,差异具有统计学意义(t=5.392,P<0.001)。ROC曲线分析提示,miRNA-148a诊断AIS的曲线下面积为0.79(95%CI0.70~0.89,P<0.001)(图1)。

2.2 miRNA-148a与急性缺血性卒中患者临床资料的相关性 根据AIS患者miRNA-148a相对表达量的中位数将其分为低水平组(<0.74,n=21)和高水平组(≥0.74,n=21),结果表明两组患者的脑梗死面积、HDL-C和hs-CRP水平存在显著差异(表1)。Spearman相关性分析提示AIS患者的miRNA-148a水平与脑梗死面积(r=-0.34,P=0.03)和hs-CRP(r=-0.43,P=0.005)均负相关,而与其他临床资料无关。

2.3 GSE55937数据集中miRNA-148a的表达在公共数据集G SE55937中,A IS患者的miRNA-148a相对表达量为1.93±0.46,而对照组的miRNA-148a相对表达量为2.52±1.00,差异具有统计学意义(t=2.64,P=0.011)。ROC曲线分析表明,miRNA-148a诊断AIS的曲线下面积为0.69(95%CI0.54~0.84,P=0.022)(图2)。

2.4 生物信息学分析 miRDB、miRTarBase和TargetScan 三个数据库同时预测到58个miRNA-148a的靶基因,包括WNT10B、DNMT1等(图3)。GO和KEGG富集分析提示,这些靶基因主要涉及的生物学过程包括细胞凋亡的正向调控、神经元分化以及凋亡相关的线粒体膜蛋白插入的正向调控等,主要涉及的信号通路包括叉头框转录因子O亚族信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B信号通路、转化生长因子-β信号通路等(表2)。

表1 不同miRNA-148a水平组急性缺血性卒中患者的临床资料比较

图2 GSE55937数据集中miRNA-148a的表达情况(左)及其诊断急性缺血性卒中的受试者工作曲线(右)

图3 miRNA-148a的靶基因预测(左)及其调控网络(右)

3 讨论

目前,AIS的发病率在我国乃至世界范围内仍居高不下,严重威胁人类健康并加重社会负担。因此,寻找AIS有效的生物标志物有重要临床意义。外周血miRNA相对稳定、不易降解且其检测方法较为敏感、准确,可作为临床疾病潜在诊断和病情鉴别的新型标志物[10]。既往研究提示,miRNA在神经系统发育和功能上起到重要作用[11]。miRNA与神经系统疾病的关系也是近年来的热点研究问题,而脑血管疾病患者的外周血miRNA也存在不同程度的差异表达。例如,Lili Zeng等[12]的研究发现AIS患者外周血的miRNA-210表达水平较对照组显著下降,尤其在发病后第7天和第14天更为明显,可能是诊断AIS的潜在标志物之一。而Jingru Wang等[13]近期的研究提示,miRNA-148/152家族的另一成员miRNA-148b可通过影响Wnt信号通路蛋白,从而参与AIS后的脑组织修复过程。本研究通过分析AIS患者的临床数据和公共数据库数据,均发现miRNA-148a在AIS患者中水平降低,且在一定程度上可反映脑梗死严重程度和炎症水平。

表2 miRNA-148a靶基因的富集分析

通过生物信息学分析,本研究共预测到58个miRNA-148a的靶基因,包括WEN10B、DNMT1等。有研究表明,miRNA-148a可通过与WEN10B直接结合,进而抑制Wnt/β-catenin通路[14]。而DNMT1是miRNA-148a的重要的靶基因[15]。抑制DNMT1则有助于保护脑缺血性损伤[16]。以上这些靶基因主要涉及细胞凋亡、FoxO信号通路、PI3K-Akt通路等分子机制。近年来的观点认为,脑缺血核心区以坏死为主,而缺血程度较轻的半暗带则以凋亡性死亡为主,因此细胞凋亡也是脑缺血造成神经系统损伤的重要机制[17]。FoxO信号通路参与调控细胞抗氧化应激、DNA修复和凋亡等过程[18]。Deyuan Li等[19]研究表明,FoxO信号通路蛋白FOXO3a与脑缺血缺氧模型大鼠的神经细胞凋亡有关,而PI3K-Akt通路则是调节AIS信号转导的重要机制之一,应用PI3K抑制剂LY294002可降低磷酸化的Akt水平,增加脑梗死体积[20]。因此,miRNA-148a可能通过调控WEN10B、DNMT1等靶基因,影响细胞凋亡和FoxO、PI3K-Akt等信号通路,从而参与AIS的发生发展。

在GEO数据库的GSE55937数据集中,AIS组miRNA-148a的表达水平也明显低于对照组,且miRNA-148a对AIS具有一定的诊断效能,表明本研究的结论相对稳定。此外,本研究利用多个miRNA数据库对miRNA-148a的靶基因进行预测,其预测的结果也相对可靠。但本研究仍有以下不足:①临床数据的样本较小且为单中心研究,因此可能导致结果有一定的偏倚;②所采集的样本均为外周血血清样本,不能明确脑组织中miRNA-148a的表达情况,但如前所述,外周血miRNA相对稳定,其检测方法较为敏感准确;③因本研究重点关注miRNA-148a在AIS早期的变化,故未对其进行连续监测,不能明确AIS患者发病后miRNA-148a的动态水平。

综上所述,A IS患者发病早期的血清miRNA-148a降低,在一定程度上可反映脑梗死程度和炎症水平,可能涉及细胞凋亡和FoxO、PI3K-Akt等信号通路。因此,miRNA-148a可能在AIS的诊断及病情评估方面具有一定参考价值。

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