中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）猴痘病毒基因组信息库MPoxVR取得进展

近日，中国科学院北京基因组研究所宋述慧研究员和鲍一明研究员受邀在国际学术期刊The Innovation在线发表题为“MPoxVR - A comprehensive genomic resource for monkeypox virus variants surveillance”的评论文章，系统比较并介绍了猴痘病毒信息库MPoxVR的数据资源及特色功能。

1970年在刚果民主共和国发现首例猴痘病毒感染者以来，猴痘疫情先后多次在中西非国家爆发。自2022年5月至今，多个非流行区国家出现猴痘疫情。为支撑猴痘病毒相关研究，帮助国内外预防和应对猴痘疫情的爆发，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）组建猴痘研究工作组，于6月10日发布猴痘病毒资源库MPoxVR。

MPoxVR收录整合了迄今为止来自GenBank的777条猴痘病毒和12065条其它痘病毒科的基因组序列及其对应元信息，并通过人工审编补充了部分序列中缺失的元信息，如宿主、采样日期和采样地点等，为研究人员开展基于序列的比较、传播演化分析等提供了基础数据资源。

▲MPoxVR数据库序列地理分布和变异数分布

MPoxVR还提供了丰富的基因组变异和功能注释信息，变异数据提示，采样自2022年5月疫情爆发以来的序列突变较少，大部分序列的SNP变异数量范围为0-11个，重要功能基因如免疫逃逸、宿主范围、细胞增殖、抗病毒药靶等的突变发生率较低，核酸检测的引物结合区尚未发生新的变异。猴痘病毒的变异信息可为其传播链追踪、溯源、疫情防控和疾病治疗等提供重要的数据信息与决策支撑。此外，MPoxVR还开发了四个重要的在线分析工具，包括基因组注释、基因组变异鉴定、变异功能注释和序列相似性比对BLAST。

与国际上其它痘病毒相关数据库相比，MPoxVR是猴痘病毒基因组及序列信息和分析工具的综合专业库，将促进猴痘病毒来源、传播方式等相关研究，服务于疫情防控。