猪圆环病毒2型CC株ORF3基因序列分析及真核表达

2012-08-08 06:13黄文明徐廷川张亮权张得玉张民泽张桂红
中国兽医杂志 2012年5期
关键词:核苷酸质粒氨基酸

黄文明,徐廷川,张亮权,张得玉,张民泽,张桂红

(华南农业大学兽医学院,广东 广州 510642)

猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)属于圆环病毒科圆环病毒属,是一种无囊膜的单股负链环状DNA病毒。PCV2是引起断奶仔猪多系统衰竭综合征(Post-weaning multisystemic wasting syndromme,PMWS)的主要病原,成为危害养猪生产的重要病原之一。

Hamel等[1]应用软件对PCV基因组进行了分析,发现PCV基因组含有11个潜在的开放阅读框(ORF),ORF1、ORF2为主要阅读框,ORF1编码与病毒复制相关的蛋白(Rep),ORF2编码病毒的主要结构蛋白(Cap)。近年来,针对PCV2基因功能的研究主要集中在ORF1和ORF2基因[2]。ORF3基因为近两年来新鉴定的一个具有重要功能的基因,其编码的蛋白对病毒在细胞培养物中的复制是非必须,但介导PCV2诱导的细胞凋亡[3]。

本试验从疑似PMWS的死亡仔猪组织病料中扩增得到了ORF3基因并对其进行了序列分析,成功的表达重组pEGFP-N2-ORF3蛋白,为进一步研究PCV2在华南地区的分子流行病学、遗传变异及防治奠定了基础。

1 材料

1.1 病料 广东省佛山市某猪场送检病料(断奶仔猪的脾、淋巴结、肺等),-70℃ 保存备用。

1.2 质粒、菌株和试剂 大肠杆菌JM109、BL21由华南农业大学兽医学院传染病研究室保存;pEGFP-N2真核表达载体购自CLONTECH公司;DNA提取试剂盒、限制性内切酶Eco R I和Xho I、DNA Marker DL-2000均为宝生物工程(大连)有限公司产品;E.Z.N.A.Gel Extraction Kit、Plasmid Mini Kit为OMEGA公司产品;其他常规试剂均为国产分析纯试剂。

1.3 引物 根据GenBank中PCV2的核酸序列,设计一对扩增ORF3的引物,并在上、下游引物分别加入Eco RⅠ和SalⅠ的酶切位点。引物由上海英骏生物技术有限公司合成。

上 游 引 物 A:5′-CTCGAGATGGTAACCATCCCACCACTTG-3′

下游引物 B:5′-GAATTCTTACTGATAGAATGTGGAGC-3′

1.4 模板的制备 取少量死亡猪组织病料充分研磨制成悬浮液,反复冻融3次,10000r/min离心取上清,用DNA抽提试剂盒提取DNA,取适量用作PCR模板。

1.5 ORF3片段的PCR扩增 采用20μL体系:灭菌双蒸水13.5μL;10×PCR Buffer(Mg2+Plus)2μL;2.5mmol/L each dNTP Mixture 2μL;上、下游引物各0.5μL;TaKaRa TaqTMDNA 聚合酶0.25μL;DNA 2μL。扩增条件:95℃5min预变性;然后95℃1min,53℃30s,72℃40s,30个循环,72℃6min。1%琼脂糖凝胶电泳观察。

1.6 PCR产物的克隆 回收上述PCR产物,用Eco RⅠ和SalⅠ对获得的PCR回收产物进行双酶切,酶切后连接到pMD18-T载体上;转化至E.coli DH5α感受态细胞中,提取重组克隆质粒,经PCR和酶切鉴定,筛选阳性克隆测序并进行序列分析。

1.7 重组表达载体的构建 双酶切重组克隆质粒后将获得的ORF3片段与双酶切后的pEGFP-N2载体连接、转化;通过酶切和PCR筛选、测序鉴定含目的片段的重组子,并命名为pEGFP-N2-ORF3。

1.8 转染用质粒的提取 使用OMEGA无内毒素大提质粒试剂盒提取,按说明书操作。

1.9 细胞转染 将正常培养的PK15细胞用胰酶消化,800r/min离心5min,去上清,细胞用无抗生素无血清的RPMI 1640培养液重悬。将细胞以2×105/孔接种于预置玻片的24孔板中,37℃培养。待细胞生长到占玻片约70%~80%时,进行转染。转染过程根据Invitrogen转染试剂盒说明书进行。

2 结果与分析

2.1 ORF3目的片段扩增 PCR产物经琼脂糖凝胶电泳,可见一条约315bp的条带,该条带的大小与目的片段ORF3的预期大小相符(图1)。

图1 ORF3基因的PCR扩增产物

2.2 同源性比较及序列分析 测序得知,克隆于重组质粒中的ORF3基因长315bp,与预期相符,它编码105个氨基酸(图3),该基因在GenBank中的登录号为BAA88133。将该基因与GenBank中的PCV2 毒 株 (AF055392、AF055394、EU148503、AY181946、EF524532、AF364094,毒株均为 PCV2分型标准株)的ORF3基因核苷酸及推导氨基酸序列进行了同源性比较。结果显示,PCV2 CC株ORF3的核苷酸序列与参考毒株的相似性为96.2%~99.0%,推导的氨基酸序列同源性为90.5%~98.1%(表1)。同时还可以看出,PCV2 ORF3C-端都含有大量的亲水性氨基酸(Ser)且较为保守(图3)。

图2 PCV2CC株ORF3基因核苷酸序列及其推导的氨基酸序列

表1 PCV2CC株ORF3与参考株ORF3基因核苷酸和氨基酸序列的同源性比较 (%)

图3 PCV2ORF3基因推导的氨基酸序列比较

2.3 ORF3真核表达载体的构建及鉴定 重组的pEGFP-N2-ORF3经Eco RⅠ和XhoⅠ双酶切,和PCR鉴定,结果表明,Eco RⅠ和XhoⅠ双酶切可以切出和315bp的DNA片段。用引物A和B作扩增,可获得约315bp的目的片段(图4)。

2.4 细胞转染 将pEGFP-N2-ORF3融合表达载体和pEGFP-N2载体分别转染COS-7细胞,激光共聚焦显微镜观察蛋白表达情况。pEGFP-N2转染细胞于培养后5~6h在细胞内可见分布均匀的亮绿色荧光(图5-a),且随培养时间的延长细胞不出现死亡;而转染pEGFP-N2-ORF3的细胞均于转染后7~8h出现荧光(图5-b),继续培养至38h荧光细胞的数量明显减少,荧光细胞大量死亡后飘浮在细胞生长液中。与对照组相比,试验组许多细胞收缩,细胞内出现空泡,细胞膜发泡,细胞的染色质浓缩,并靠近核膜,有核着边现象,核膜裂解、染色质分割成块状,晚期形成凋亡小体,并从皿底脱落、死亡。

图4 重组质粒pEGFP-ORF3的酶切鉴定

图5 pEGFP-N2-ORF3在COS-7细胞中的表达 (10×)

3 讨论

本试验选用疑似PMWS的死亡仔猪组织病料,应用PCR技术成功的扩增了ORF3基因,通过克隆与测序,发现与其他PCV2毒株的ORF3核苷酸序列相似性为96.2%~99.0%,推导的氨基酸序列同源性为90.5%~98.1%,其中与AF055392-ORF3a和AF055394-ORF3b的核苷酸序列同源性为99.0%,氨基酸序列同源性为98.1%,同源性相对较高,说明CC株可能属于其中一个亚型;而与AF364094-ORF3f的核苷酸序列同源性为97.8%,氨基酸序列同源性为94.3%,同源性相对较低,可能与这些毒株的分离地点不同有关,也就是说PCV毒株存在地区差异性[4]。从总体情况来看,PCV2的ORF3基因变异相对较大,有些毒株之间的ORF3核苷酸及推导的氨基酸序列同源性仅为96.2%和90.5%,变异散布于整个ORF3,这些差异可能与ORF3介导的细胞凋亡速度有关,须进一步试验研究。

近年来,已经有不少学者关于Rep蛋白感染细胞定位的研究,Gilpin等[5]用PCV2感染PK15细胞后,发现Rep蛋白主要位于细胞核,但是很少对ORF3编码蛋白产物进行细胞感染定位。本试验成功构建了重组质粒pEGFP-N2-ORF3,将pEGFP-N2-ORF3转染COS-7细胞,在细胞核和细胞浆内可见分布均匀的亮绿色荧光,尤其在细胞核中表达量较高,而在38 h后部分细胞死亡后漂浮于细胞液上,表明融合表达的ORF3编码产物对细胞有毒性作用,能够加速细胞死亡,与李增魁的报道一致[6]。ORF3重组蛋白的成功表达为研究ORF3编码蛋白的生物学活性及病毒感染的致病的分子机理、病毒遗传变异特征等领域的深入和系统研究奠定了基础。

[1]Hamel A L,Nayar G P.Nucleotide sequence of porcine circovirus associated with postweaning multisystemic wasting syndrome in pigs[J].J Virol,1998,72:5262-5267.

[2]林彦星,孙彦伟,刘镇明,等.猪圆环病毒II型ORF2截短基因的克隆及原核表达 [J].中国兽医学报,2007,27(4):464-468.

[3]Liu J,Chen I,Kwang J.Characterization of a previously unidentified viral protein in Porcine circovirus type 2-infected cells and its role in virus-induced apoptosis[J].J Virol,2005,79(13):8262-8274.

[4]卢银华,陈德胜,华修国,等.猪圆环病毒2型ORF2基因序列分析及真核表达载体的构建 [J].中国病毒学,2002,17(1):87-91.

[5]Gilpin D F,Mc Cullough K,Meehan B M,et al.In vitro studies on the infection and replication of porcine circovirus type 2 in cells of the porcine immune system [J].Vet Immunol Immunopathol,2003,94(3-4):149-161.

[6]李增魁.猪圆环病毒2型ORF3编码蛋白的体外表达[J].畜牧与兽医,2008,40(9):25-30.

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