辽宁汉族27个Y-STR基因座的遗传多态性

2018-01-26 06:31王立铭邢佳鑫宣金锋王保捷
法医学杂志 2017年6期
关键词:基因座汉族等位基因

姚 军 ,王立铭 ,贵 靖 ,邢佳鑫 ,宣金锋 ,王保捷

(1.中国医科大学法医学院法医物证学教研室,辽宁 沈阳 110122;2.大连市公安局刑事科学技术研究所,辽宁 大连116011)

在法医学亲子鉴定和个体识别中,Y染色体STR基因座(Y-STR)具有独特的优势,主要是由于其男性伴性遗传的特点[1-2]。在一些强奸案件的鉴定中,YSTR分型可以提供男性嫌疑人的遗传信息,并且基因分型结果不受女性成分的影响[3]。此外,Y-STR基因座缺乏重组,具有独特的单倍型特征,在了解人类群体特征和进化等方面具有重要的作用[4]。本研究拟调查获得中国辽宁汉族群体27个Y-STR基因座的遗传学参数,为法医物证学提供更多的群体遗传学数据。

1 材料与方法

1.1 样本来源

辽宁地区汉族无血缘关系男性个体血样(血卡)267份,均来自本实验室日常建库积累。

1.2 Y-STR扩增及分型

用 Chelex-100法提取 DNA[5],用 Yfiler®Plus PCR试剂盒(美国AB公司)和9700型PCR仪(美国AB公司)对27个Y-STR基因座进行扩增,用3130xl基因分析仪(美国AB公司)进行毛细管电泳,用Gene-Mapper®ID v3.2软件进行基因分型。

1.3 统计学处理

使用PowerMarker v3.25软件计算等位基因分布频率和基因多样性(GD)[6]。使用Arlequin v3.5软件计算单倍型频率、单倍型多样性(HD)[7]和识别率(discrimination capacity,DC)[8]。 Y-STR 基因座单倍型结构分析使用YHRD数据库(http://www.yhrd.org/)进行,应用YHRD数据库在线工具(http://www.yhrd.org/Analyse/AMOVA)的分子方差分析(analysis of molecular variance,AMOVA)计算辽宁汉族群体和广东汉族、河南汉族、甘肃藏族、德国人、拉美裔美国人(源自YHRD数据库,http://www.yhrd.org/search)的遗传距离(Rst值),同时生成多维尺度图(multidimensional scaling,MDS)。

2 结果与讨论

27个Y-STR基因座的等位基因频率分布和GD值见表1~2,其中DYS385和DYS387S1分别含有2个基因座。经对267名辽宁汉族男性无关个体进行检测,DYS385a/b和DYS387S1a/b基因座分别检出48种、34种单倍型;其余23个Y-STR基因座中,DYS437基因座检出的等位基因数最少(4个),DYS518基因座的等位基因数最多(16个)。27个Y-STR基因座中,DYS438的 GD 值最低 (0.427 3),DYS385的 GD值最高(0.9599)。267名个体中,共发现255种单倍型,其中243种仅单个个体具有,12种单倍型检出了2次。HD值为0.9962,DC值为0.9551。

表1 27个Y-STR基因座在辽宁汉族群体的等位基因频率分布情况 (n=267)

表1 (续)

表2 27个Y-STR基因座在辽宁汉族群体中的GD值 (n=267)

辽宁汉族男性和YHRD数据库中其他群体的遗传距离比较结果见表3,MDS结果见图1。群体比较分析结果表明:尽管和河南汉族、广东汉族群体具有较近的遗传距离,但辽宁汉族群体仍具有自己独特的遗传结构和群体特征。

综上,Yfiler®Plus PCR试剂盒中27个Y-STR基因座在辽宁汉族群体中具有较好的遗传多态性,可以用于个体识别和亲权鉴定。

表3 辽宁汉族群体与YHRD数据库中其他群体间的遗传距离

图1 辽宁汉族和YHRD数据库中其他群体的MDS结果

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