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  • 受棉铃虫诱导的棉花糖基转移酶UGT基因家族的生物信息学及表达分析
    物种来源及基因登录号来自棉花的基因UGTG01(基因登录号,KX398934)、UGTG02(基因登录号,KX398935)、UGTGo4(基因登录号,MN701073)、UGTGo6(基因登录号,MN812721),UGTGo7(基因登录号,MN820705);来自山芥的基因BvUGT1(基因登录号,JQ29161)、BvUGT73C9(基因登录号,JQ291612)、BvUGT73C10(基因登录号,JQ291613)、BvUGT73C11(基因登录号

    新疆农业科学 2023年10期2023-11-10

  • 云南省怒江州独龙牛内阿米巴原虫的感染情况调查
    07/BEL(登录号:GU437825)、中国的牛源Entamoebasp.MG107/BEL(登录号:MT734309)、中国的牛源E.bovis(登录号:MT734187)、冰岛的鹿源E.bovis(登录号:FN666252)、瑞典的羊源E.bovis(登录号:FN666250)、瑞典的牛源E.bovis(登录号:FN666249)、瑞典的鹿源Entamoebasp.RL1(登录号:FN666253)、瑞典的牛源Entamoebasp.RL2(登录号:

    动物医学进展 2023年10期2023-10-24

  • 安徽省5株新型鹅星状病毒的分离鉴定与遗传进化分析
    GenBank登录号:MF772821),设计7对引物(表2),包含病毒的全基因组且相互重叠。引物委托南京擎科生物科技有限公司合成。表2 GAstV全基因测序引物的基本信息Table 2 Basic information of primers for genome sequencing of GAstV取上述分离到的GAstV各毒株的F3代病毒液进行RNA提取与反转录,其中,反转录引物使用各段测序引物的下游引物。利用设计的引物对各毒株的全基因组序列分段扩

    浙江农业学报 2023年5期2023-06-09

  • 基于NCBI核酸数据库的田头菇属Agrocybe真菌系统发育探析
    致；其次，不同登录号的湿粘田头菇A.erebia 单独聚为一类，系统发育关系较为清晰，并与褐色田头菇A.brunneola 一起归为具幕田头菇组Sect.Velatae；再次，平田头菇A.pediades 与其环状变种A.pediades Var.cinctula 和粪生变种A.pediades Var.fimicola 整体聚为一类，同归为平田头菇组（Sect.Pediades）；此外，硬田头菇A.dura，沼生田头菇A.paludosa 和模式种田头菇

    科技视界 2022年25期2022-12-30

  • 腐生性钩端螺旋体Potoc 菌株全基因组学分析
    株（NCBI 登录号：NC_010842.1、NC_010845.1和 NC_010846.1）进行比较基因组学分析，并与已发表致病性钩体问号基因种 56601 菌株（NCBI 登录号：NC_004342.2 和 NC_004343.2）、波氏基因种 56142 菌株（NCBI 登录号：SRX673783）和中间型L.licerasiaeVAR010 菌株（NCBI 登录号：NZ_AHOO00000000.2）基因组进行共有与特有的基因比较分析。同时将上述

    中国医药生物技术 2022年6期2022-12-09

  • 太行鸡CCNB2基因剪接异构体的克隆鉴定及其在卵泡发育中的表达模式分析
    GenBank登录号：XM_015278893.2和XM_015278892.2)，利用Primer Premier 5.0软件按照图1设计CCNB2基因剪接异构体鉴定引物，引物序列为：CCNB2-F：5′-AAGATGAAAAGCAGTGGGA-3′；CCNB2-R：5′ -AAGACAGAGGACAGGGATAC-3′。引物由苏州金唯智股份有限公司合成。图1 CCNB2剪接异构体鉴定模式图Fig.1 Schematic diagram of CCNB2

    中国畜牧兽医 2022年10期2022-10-20

  • 长白猪Plin3、Plin5基因克隆及表达规律研究
    apiens，登录号：NP_001157661.1)、猪(Susscrofa，登录号：NP_001026948.1)、家鼠(Musmusculus，登录号：NP_080112.1)、斑马鱼(Daniorerio，登录号：NP_001373243.1)、家犬(Canislupusfamiliaris，登录号：XP_038284951.1)、家猫(Feliscatus，登录号：XP_023106648.1)、山羊(Caprahircus，登录号：NP_0012

    核农学报 2022年9期2022-09-21

  • 牦牛源BVDV非结构蛋白NS5A的原核表达及抗原表位分析
    GenBank登录号：KX170647)，利用Primer Premier 5.0软件设计1对特异性检测引物(BVDV NS5A-F:5′-CCCAAGCTTATGTCTGGGAA-3′，BVDV NS5A-R:5′-TATACAATGAAGCTAGGATCCGCG-3′)扩增NS5A基因,预期扩增片段大小为1 488 bp，下划线部分分别为Hind Ⅲ和BamHⅠ的酶切位点。引物由金唯智生物有限公司合成。1.2.3 PCR扩增BVDVNS5A基因 利用反

    中国畜牧兽医 2022年8期2022-08-23

  • 新疆阿克苏地区部分猪场流行性腹泻病毒的检测与分析
    GenBank登录号：MN692793）的PEDV序列信息，设计PEDV M基因特异性片段鉴定的引物，由生工生物工程（上海）股份有限公司合成。引物序列为：上游引物5'-GGCGAATTCCGGT TCTATTCCCGTTGATG-3'，下游引物5'-GGCCTCG AGATGAAGCACTTTCTCACTAT-3'，预计扩增片段大小为663 bp。2.3 PCR扩增目的基因在PCR管中，加入cDNA 1 μL，上游引物和下游引物各0.5 μL，EasyTa

    养猪 2022年4期2022-08-17

  • 低纬高原甘蔗锈病病原菌鉴定及系统进化分析
    GenBank登录号见表1)提交NCBI网站进行BLAST同源性比较分析。结果表明：云南勐海海引1号4份甘蔗锈病病原的核苷酸序列(GenBank登录号：KP201840～KP201843)与已报道的屈恩柄锈菌核苷酸序列(GenBank登录号：GU058021)同源性在99.9%以上，表明该病原是屈恩柄锈菌(表1)；云南保山、临沧、勐海、孟连、西盟、澜沧和文山其他甘蔗品种上的53份甘蔗锈病病原核苷酸序列(GenBank登录号：KP201824～KP20183

    西南农业学报 2022年6期2022-08-06

  • 芫荽NPR1-like家族全基因组鉴定及分析
    NPR1～6的登录号分别是At1g64280、At4g26120、At5g45110、At4g19660、At2g41370、At3g57130，水稻()OsNPR1～3和OsNPR5的登录号分别是ABE11614、ABE11615、ABE11618、ABE11622，大麦()HvNPR1的登录号是CAJ19095，二穗短柄草()BdNPR1的登录号是XP_003564857，玉米()ZmNPR1的登录号是NP_001354806，小麦()wNPR1的登录

    江苏农业科学 2022年13期2022-07-29

  • 鸡miR-10b-5p生物信息学及组织表达分析
    taurus，登录号：MIMAT0003839）、家犬（Canisfamiliaris，登录号：MIMAT0009837）、山羊（Caprahircus，登录号：MIMAT0035913）、豚鼠（Caviaporcellus，登录号：MIMAT0046847）、锦龟（Chrysemyspicta，登录号：MIMAT0037627）、原鸽（Columbalivia，登录号：MIMAT0038406）、灰仓鼠（Cricetulusgriseus，登录号：MIM

    中国畜牧兽医 2022年4期2022-06-01

  • LMTIA技术检测HPV核酸的可行性研究
    中HPV16(登录号：FJ006723)、HPV18(登录号：AY262282)、HPV35(登录号：HQ537722)、HPV39(登录号：KC470249)、HPV45(登录号：EF202162)、HPV51(登录号：KU298904)、HPV52(登录号：AB819274)、HPV56(登录号：EF177181)和HPV58(登录号：AB819276)的基因组，通过BLAST在线比对软件选取保守序列，并使用Oligo 7软件(美国Molecular

    许昌学院学报 2022年2期2022-04-15

  • 乌药matK基因的生物信息学及多样性分析
    nzoin），登录号：MG220997.1；香叶树（Lindera communis），登录号：AF244405.1；绿叶甘植（Lindera fruticosa），登录 号：AF244405.1；黑壳 楠（Lindera megaphylla），登录号：AF244404.1；滇粤山胡椒（Lindera metcalfiana），登录号：AF244403.1；三桠乌药（Lindera obtusiloba），登录号：AF244402.1；山橿（Linder

    湖北农业科学 2022年6期2022-04-13

  • 甘肃玉米镰孢茎腐病病原菌种群多样性分析
    发现TW30(登录号：MT827971)和ZY13-2(登录号：MT879692)与变红镰孢(登录号：JF270223、JF270200和GU116584)聚为一支；YJ8-1(登录号：MT879693)和ZY7-1(登录号：MT879694)与木贼镰孢(KT213320、KT213319和KT213315)聚为一支；HHXHZ15-7(登录号：MT879684)与布氏镰孢(MK896870、MH582231和KX269078)聚为一支；HCSZ4-9(登

    核农学报 2021年11期2022-01-04

  • 基于传统分类与ITS序列分析法对真菌的鉴定研究
    Bank，获得登录号，选择其中最短的扩增序列，以此长度为基本比对长度，在NCBI(National Center for Biotechnology Information）数据库寻找登记序列中含有与12种真菌样品序列相似度高的片段，通过BLAST工具和DNAMAN软件对序列进行分析，截去两侧扩增差异较大的碱基对，使比对的序列大小几乎一致，重新用Clustalx软件进行完全比对，用MEGA7.0软件采用邻位相连法(N-J，neighbor-joining）

    食用菌 2021年6期2021-12-30

  • 俄藏西夏文献《天盛改旧新定律令》未刊情况概述
    盛律令》内容的登录号有：инв.№113、114、152—154、156—169、170c、171a、171г、173—180、180a、181—188、194—200、200a、201—204、219、710、713、785—787、789、2325—2332、2558、2569—2608、3810、4054、4180a、4180б、4181、4182、4184、4188、4429、4432、4542、4552、5040、5451、5793、6105、6

    西夏研究 2021年4期2021-11-25

  • 猪IGFBP3基因生物信息学分析
    mRNA序列(登录号:NM001005156)及其编码的蛋白质序列(登录号:NP001005156)。同时，下载其它种属黄牛(登录号:NP_776981)、水牛(登录号:XP_006051369)、绵羊(登录号:NP_001152748)、山羊(登录号:NP_001301148)、猫(登录号:XP_023105911)、狗(登录号:XP_003639605)、小鼠(登录号:NP_032369)、大鼠(登录号:NP_036720)、鸡(登录号:NP_0010

    安徽科技学院学报 2021年2期2021-08-24

  • 云南新平蔗区发现甘蔗白条病
    息：XP1S（登录号MT625864）、XP2S（登录号MT625865）、XP3S（登录号MT625866）、XP4S（登录号MT625867）、XP5S（登录号MT625868）、XP6S（登录号MT625869）、XP7S（登录号MT625870）、XP8S（登录号MT625871）。1.2 蔗汁总DNA提取将蔗茎表面用自来水清洗3 次去除表面污物，75%的酒精消毒20 s 后，用火将表面酒精烧尽，重复2 次进行表面消毒。把蔗茎切成长为5～8 cm

    中国糖料 2021年3期2021-07-13

  • 牛Bcl-2基因生物信息学功能预测分析
    公布的抹香鲸（登录号XM_007105114.3）、小鰛鲸（登录号XM_007192009.1）、虎鲸（登录号XM_004268067.2）、太平洋短吻海豚（登录号XM_027118704.1）、长肢领航鲸（登录号XM_030868121.1）、非洲野驴（登录号XM_014843802.1）、山羊（登录号KJ782301.1）、牦牛（登录号MK050976.1）、北美野牛（登录号XM_010854740.1）、印度牛（登录号XM_019986619.1）、

    黑龙江动物繁殖 2021年3期2021-07-12

  • 重寄生拟盘多毛孢cr013菌株聚酮合酶基因的多样性分析*
    -1[17](登录号：W3X7U2.1；A0A067XNI2.1)的PKS蛋白的KS保守结构域蛋白质序列为模板，对cr013菌株的基因组进行搜索，挖掘cr013菌株基因组中潜在的PKS基因，并利用Conversed Domain Database数据库分析挖掘到的PKS蛋白的结构域。1.2.3 PKS蛋白的聚类分析从NCBI上下载已知功能的高度还原性PKS、部分还原PKS和非还原PKS的蛋白质序列作为参考序列，以此构建系统进化树。通过Clustal W对挖

    西部林业科学 2021年3期2021-06-24

  • 参与调控意大利蜜蜂工蜂中肠基因表达的东方蜜蜂微孢子虫miRNA的组学解析及其调控网络
    GenBank登录号: XM_006564187.2, XM_006567501.2和XM_006558063.2等)；19条共有的显著下调miRNA(novel-m0016-3p, let-7-x和miR-122-x等)靶向AmCK1vsAmT1和AmCK2vsAmT2中14条皆显著上调的mRNA (GenBank登录号: XM_016912123.1, XM_006558673.2和XM_016916036.1等)。NcCKvsNcT1中共63条特有的

    昆虫学报 2021年2期2021-04-13

  • 青头菌(Russula virescens)聚酮合酶基因的克隆及碳源对该基因表达的影响
    GenBank登录号MW307354)、β-tubulin(GenBank登录号MW307355)和elongation factor 1α(GenBank登录号：MW307356)鉴定后，该菌种为青头菌(R.virescens)，并将该菌株命名为Rv-yaf-001.1.2 试剂与仪器真菌RNA提取试剂盒(康为世纪公司)，高保真DNA聚合酶(TaKaRa公司)，NanoDropTM2000紫外分光光度计(赛默飞世尔科技公司)，真菌总RNA提取试剂盒(Ta

    福建农林大学学报（自然科学版） 2021年2期2021-04-08

  • 基于DNA条形码进行金花茶组种间鉴别
    -tmH序列(登录号：GQ 487336.1)、1个rpl 16序列(登录号：GQ 487366.1)及2个trnl-trnF序列(登录号：HQ 158589.1，GQ 487426.1)；金花茶： 1个psbA-tmH序列(登录号：GQ 487354.1)、1个rpl 16序列(登录号：GQ 487384.1)及1个trnl-trnF序列(登录号：GQ 487444.1)；显脉金花茶：1个psbA-tmH序列(登录号：GQ 487339.1)、1个rpl

    种子 2021年2期2021-03-31

  • 20种中药基原植物鲨烯合酶基因的生物信息学分析
    Hoffm（登录号AQV11962.1）、人参Panax ginsengC.A.Meyer（登录号 ACV88718.1）、三七Panax notoginseng(Burkill) F.H.Chen ex C.H.（登录号AIK21786.1）、西洋参Panax quinquefoliumL.（登录号（AED99863.1）、竹节参Panax japonicas(T.Nees)C.A.Mey.（登录号 ALB38664.1）、刺五加Acanthopana

    中草药 2021年3期2021-02-03

  • 103个mcr质粒的结构与特征
    0R(NCBI登录号：KY689633)，达256 260 bp[20]；最小的是未命名的质粒unamed1(NCBI登录号：KX528699)，为15 998 bp[21]。这些质粒至少可以划分为7种不同的复制子类型，包括IncHI2、IncHI1A、IncN、IncFII、IncI2、IncX4、IncP1，与Wang等的报道一致[22]，其中IncI2占比最高，为50.5%；其次为IncX4，占比为24.3%。IncHI2类型的质粒较大，通常在200

    浙江农业学报 2021年1期2021-01-28

  • 棉花根际土壤真菌分离及黄萎病菌拮抗菌的筛选
    99.83%（登录号KX058045.1）、EF-1α序列与C.rosea菌株同源性为97.99%（登录号MK752496.1）、β-tubulin序列与C.rosea菌株同源性为98.07%（登录号KJ413352.1）、Actin序列与C.rosea菌株同源性为98.85%（登录号MH102067.1）。分离获得的B51菌，其ITS序列与粉红粘帚霉C.rosea菌株的ITS序列同源性为99.82%（登录号MT845995.1）、EF-1α序列与C.ro

    塔里木大学学报 2020年4期2021-01-13

  • 梅迪-维斯纳病毒gag蛋白的原核表达及其交叉反应原性
    GenBank登录号为KT749881)后的阳性血清，均为本实验室保存。1.1.3 引物设计与合成 以GenBank上登录的MVV基因组gag基因序列(登录号：NC001452.1)为参考序列，利用Oligo 7.0软件设计上游引物gag-F：5′-CATGCCATGGCGAAGCAAGGCTCAAAGGAGA-3′(斜体为NcoⅠ酶切位点)、下游引物gag-R：5′-AAACTCGAGCAACATAGGGGGCGCGGACGGCA-3′(斜体为XhoⅠ酶

    江苏农业学报 2020年4期2020-09-10

  • 铜绿假单胞菌遗传演化分析
    自日本的Pa（登录号为NR_113599）关系最为亲近，他们聚在一个次级分支上；分离菌株与来自美国的两株Pa（登录号为NR_117678与NR_114471）关系较亲近，而与来自德国的Pa（登录号为NR_026078）关系则较远。铜绿假单胞菌；遗传演化；基因树；亲缘关系铜绿假单胞菌，又称绿脓杆菌，为革兰阴性杆菌，该菌在1882年首先由Gersard氏从伤口脓液中分离到[1]。铜绿假单胞菌在环境中普遍存在，常见于正常人与动物肠道、皮肤上，也可在外伤、烧伤及尿

    天津农学院学报 2020年2期2020-07-13

  • 甘薯等20种作物蔗糖转化酶抑制子生物信息学分析
    基酸序列，序列登录号分别如下：烟草(Nicotianatabacum)，登录号：XP_016474343；辣椒(Capsicumannuum)，登录号：XP_016551458；番茄(Solanumlycopersicum),登录号：AGC75063；南方菟丝子(Cuscutaaustralis)，登录号：RAL38588；马铃薯(Solanumtuberosum)，登录号：AYV96510；小果咖啡(Coffeaarabica)，登录号：XP_02711

    西南农业学报 2020年4期2020-06-22

  • 转录组分析揭示东方蜜蜂微孢子虫侵染意大利蜜蜂的分子机制
    GenBank登录号: 36320842)作为内参基因，利用Primer Premier 5设计引物(表1)，委托福州擎科生物有限公司合成。利用RNA提取试剂盒(TaKaRa公司，大连)分别提取NcCK以及NcT1和NcT2中肠总RNA(熊翠玲等, 2019)，然后利用cDNA第1链合成试剂盒(Vazyme公司，南京)反转录成cDNA，作为模板进行qPCR，反应在QuantStudio 3(ThermoFisher公司，美国)上进行。qPCR反应按照SYB

    昆虫学报 2020年3期2020-05-22

  • 猪圆环病毒3型河北株全基因组序列特征和遗传进化分析
    enBank(登录号：MK105924).M：DL2000 DNA Marker；1：淋巴结组织；2：阴性对照.M：DL2000 DNA Marker；1：Lymph node tissue；2：Negative control.图1 PCV3检测结果Figure 1 PCV3 test resultsM：DL2000 DNA Marker；1： PCV3-1的PCR产物；2：阴性对照. M：DL2000 DNA Marker；1： PCR product

    甘肃农业大学学报 2020年1期2020-04-14

  • 浙贝母黑斑病致病菌的分离鉴定及分子检测
    k中链格孢菌（登录号：MG182428）、细极链格孢菌（登录号：MF356594）、芸苔链格孢菌（登录号：MG733697）等16条序列的同源性均为100%；与葱链格孢菌（登录号：KU293590）、苹果链格孢菌（登录号：KU293580）同源性为99.82%；与长柄链格孢菌（登录号：MK675101）、鸭梨链格孢菌（登录号：MK675102）、乔木交链孢菌 （登录号：MK460966）、甘蓝链格孢菌（登录号：MK311298）同源性为99.64%。分离物

    浙江中医药大学学报 2020年2期2020-04-01

  • 基于28S rDNA部分序列的金沙江德泽段鲶寄生撒氏虫属(Thaparocleidus)单殖吸虫的系统发育*
    GenBank登录号.基于BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)选择GenBank中同属物种进行序列分析，用MEGA7.0[33-34]计算序列间转换/颠换值，并基于双参数模计算遗传距离，以伪锚盘虫属(Pseudancylodiscoides)单殖吸虫作为外群，通过最大似然法(maximum likelihood，ML)、邻接法(neighbor-joining，NJ)和最大简约法(maximum parsimon

    云南师范大学学报（自然科学版） 2019年4期2019-07-30

  • 含氟新农药的研究进展
    621，CAS登录号为1360819-11-9，对霜霉病有着卓越的效果。Fluoxapiprolin为外消旋体，其R-体和S-体几乎拥有同样的生物活性。其分子结构与科迪华的氟噻唑吡乙酮（Oxathiapiprolin）非常相似，仅在吡唑环和苯环上有少许区别。氟噻唑吡乙酮作为一种全新作用机制的杀菌剂，年峰值将超过1.5亿美元，因而Fluoxapiprolin的加入将使得该类产品的市场竞争变得逐渐激烈。1.2 IpflufenoquinIpflufenoqui

    浙江化工 2019年5期2019-06-04

  • 犬副流感病毒D121004株的分离鉴定及其F基因遗传进化分析
    （2007年，登录号EF546392.1）核苷酸同源性最高，为99.5%，与我国的FA毒株（2007年，登录号EF487542.1）核苷酸同源性为99.3%，与韩国的毒（CDV）、犬细小病毒（CPV）、CPIV的多重PCR方法。这些方法的特异性、灵敏性和重复性均较好，为CPIV的分离鉴定及流行病学调查奠定了基础。CPIV具有凝集鸡红细胞的能力，与其他具有血凝性的病毒不同，它需要在4 ℃条件下进行。闫喜军等[10]采用HA/HI试验进行CPIV血清抗体流行病

    中国动物检疫 2019年2期2019-02-22

  • 山葡萄苯丙氨酸解氨酶基因(PAL)的克隆与表达分析
    GenBank登录号：JN858963)同源性达到100%，认定该序列为山葡萄PAL基因的核苷酸序列。提交PAL的核苷酸序列，GenBank(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)登录号是MH045991。运用 DNAStar 软件分析，该 DNA 序列具有完整的开放阅读框 1 671 bp，3′-UTR 为 9 bp，5′-UTR 为85 bp，推断它能编码 556 个氨基酸。命名为VamPAL。图2 VamPAL基因PCR电泳图谱

    华北农学报 2018年6期2019-01-09

  • 新报道的农药品种简介
    ol}，CAS登录号：1314008-27-9。该剂为广谱杀菌剂，对多种病害有效，预计2021年上市，预期年销售额40亿日元。Ipflufenoquin具有新颖作用机制，可用于防治对现有药剂产生抗性的病原菌。1.3 MetyltetraproleMetyltetraprole是日本住友株式会社开发的苯基吡唑类、四唑类杀菌剂，开发代号S-2367。化学名称：1-[2-[[[1-(4-氯苯基)-1H-吡唑-3-基]氧基]甲基]-3-甲基苯基]-1,4-二氢-4

    世界农药 2018年6期2019-01-05

  • 红景天AG基因(RrAG)的电子克隆及生物信息学分析
    南芥AG基因(登录号：NP_001190766.1)序列作为参考序列，在中国国家基因数据库的千种植物数据库(https：//db.cngb.org/blast4onekp/blast)中通过选择tBLASTn程序[Expectation Value(期望值，简称E值)使用SeqBuilder软件分析可知，ZJUL-2061267基因全长为1 037 bp，含有789 bp的开放阅读框，编码262个氨基酸(图1)。经NCBI网站CCD在线预测表明，该基因包含

    江苏农业科学 2018年21期2018-12-06

  • 小反刍兽疫病毒F基因的序列分析
    -F基因序列(登录号：KF648287)，用Primer Premier 5软件设计1对引物，其中上游引物(F-f)为：5′-ATGACACGGGTCGCAATCTTGA-3′；下游引物(F-r)为：5′-CTACAGTGATCTCACGTACGAC-3′。预期扩增的片段大小1 641 bp，引物由英潍捷基(上海)贸易有限公司合成，用dd H2O按10 pmol/μL稀释，置-20℃保存备用。1.2.3 PPRV-F基因的RT-PCR扩增 以PPRV总RN

    动物医学进展 2018年11期2018-12-05

  • Ⅰ群禽腺病毒hexon基因分型与序列分析
    GenBank登录号Z67970，FAdV-1型；SR48，GenBank登录号EU979368，FAdV-2型；SR49，GenBank登录号EU979369，FAdV-3型；ON1，GenBank登录号GU188428，FAdV-4型；340，GenBank登录号AF508952，FAdV-5型；CR119，GenBank登录号EU979372，FAdV-6型；YR36，GenBank登录号EU979373，FAdV-7型；TR59，GenBank登录

    动物医学进展 2018年10期2018-11-02

  • 关岭自治县某牛场蜱虫病分子诊断及驱虫试验
    rsicus，登录号：KJ133607)，以微小牛蜱(Boophilus microplus，登录号：BMU97713)、外翻扇头蜱(Rhipicephalus evertsi，登录号：DQ849265)、环形牛蜱(Boophilus annulatus，登录号：JQ412126)、消色牛蜱(Boophilus decoloratus，登录号：BDU97716)、囊形扇头蜱(Rhipicephalus bursa，登录号：KM986320)、血红扇头蜱(R

    畜牧兽医杂志 2018年5期2018-10-24

  • 奥地利发现与仔猪先天性震颤相关的新型瘟病毒（Linda病毒）
    enBank（登录号KY436034），其长度为12 614 bp，具有381 bp的5'-非翻译区，11 772 bp的开放阅读框和461 bp的3'-非翻译区。利用CLC Workbench 7.6对LV进行系统发育分析，发现LV与APPV之间的相似性仅有60%，与BV之间的相似性为68%。LV与BV氨基酸序列相似性为69%，与其他瘟病毒的氨基酸相似性＜54%。LV中含有所有已知的NS3蛋白酶裂解位点；位于典型猪瘟病毒的L/A、BV的L/S位点上的NS

    猪业科学 2018年1期2018-03-07

  • 口蹄疫病毒基因组3' 末端序列扩增及分析
    GenBank登录号：EF552696)，在病毒全基因组3'端设计1对引物及3'RACE引物，由新疆昆泰锐生物技术有限公司合成。表1表1 3'端序列扩增引物 Table 1 Primers for amplification of the 3'-end sequences引物Primer位置Position序列Sequence(5'→3')Poly(A)长度The length of Poly(A)1F7 987TCTGGACCTGACGAGTACCG1R

    新疆农业科学 2018年11期2018-02-25

  • 葡萄Actin基因家族的鉴定及进化和表达分析
    化范围较小。除登录号GSVIVG01008254001和GSVIVG01014035001的基因外，其他14个基因的GC含量均低于其CDS的GC含量。除登录号GSVIVG01008254001的基因外，其他15个基因编码的蛋白质的理论相对分子质量为12 534.54～82 612.33，理论等电点为pI 4.92～pI 9.13。16个基因编码蛋白质的消光系数为14 105～73 645，脂肪族氨基酸指数为65.54～92.06，其中9个为稳定蛋白，7个为

    植物资源与环境学报 2017年3期2017-10-12

  • 电子版馆藏数据回溯中的交叉、重叠、阻滞问题处理
    明问题下面将以登录号为例）例：一批登录号为五位“00100至00199”，另一批登录号为六位“000100至000199”，五位字符和六位字符本身并不冲突；但由于集成管理系统中的“数据库”在“馆藏信息表”中，“登录号”字段的属性设定是“定长”即固定位数（长度一般为8或10）这样导入的两批“登录号”就都变成了八位（以长度8位为例）“00000100至00000199”这样就由于不同位数“数据”的交叉而造成了数据的重叠冲突。二是期刊和图书数据导入新数据库系统中

    办公室业务 2016年19期2016-11-25

  • 卡拉干斯齿线虫的形态及ITS和COⅠ序列分析
    k数据库，获得登录号为KT984870。ITS序列总长853 bp，其中ITS1长369 bp，5.8 S长153 bp，ITS2长331 bp； ITS1区的GC含量(47.2%)明显高于ITS2区(40.7%)(图2)。在GenBank检索中，尚未发现卡拉干斯齿线虫或斯齿属内其他虫种的序列。经过Blast同源比对，与伊氏双齿口线虫(Bidentostomumivashkini)(登录号：KP693440)的同源性最高，达到94%；而与杯冠属内小杯杯冠线

    动物医学进展 2016年10期2016-10-20

  • 花生长链酰基辅酶A合成酶6基因(LACS6)的克隆、鉴定与组织表达
    GenBank登录号：KU301860)，分析该基因的结构组成，预测编码氨基酸与其他植物的同源性，采用Real-Time PCR技术对LACS6的组织表达进行研究。结果显示，花生LACS6基因全长2 116 bp，包含2 088 bp的ORF，编码695个氨基酸，有23个外显子和22个内含子。氨基酸序列比对显示花生LACS6有真核生物酰基辅酶A合成酶保守结构域，并含有保守的激活位点和绑定位点。同源性分析发现花生LACS6与鹰嘴豆、绿豆、大豆、梅等13种物种

    福建农业学报 2016年11期2016-02-13

  • 三叶青两个肌动蛋白基因片段的克隆及其分析
    GenBank登录号AM465189.1）、黄褐棉（GenBank登录号JF722026.1）和陆地棉（GenBank登录号JF722036.1）等的相似性分别为92%、85%和85%，其编码的蛋白质与刺儿菜（GenBank 登录号AEY77415.1）、月季（GenBank 登录号BAF36000.1）和覆盆子（GenBank登录号AED89635.1）等的相似性均为87%.而Th Act2核苷酸序列与葡萄（GenBank登录号XM＿002265440.

    杭州师范大学学报(自然科学版) 2015年4期2015-03-20

  • 黄颡鱼生长抑素基因的克隆及表达谱分析
    (瓦氏黄颡鱼，登录号HQ830200；斑点叉尾鮰，登录号NM_001200330)的SS基因cDNA序列，在其保守区内采用Primer 5.0设计引物S1，用于扩增黄颡鱼SS基因中间保守区序列。根据获得的黄颡鱼SS基因中间保守区序列，设计 5′ RACE 和3′ RACE特异性引物S2和S3，其中S2用于扩增SS基因的5′端序列，S3用于扩增SS基因的3′端序列。将扩增的保守区序列、5′端和3′端序列进行拼接得到黄颡鱼SS基因的cDNA序列全长。根据克隆的

    西北农林科技大学学报（自然科学版） 2015年3期2015-02-24

  • 安徽省猪流行性腹泻病毒的ORF3基因序列分析
    GenBank登录号AF353511)的基因序列设计一对引物用于扩增ORF3基因。引物由上海生物工程有限公司合成。上游引物：5′-TCCTAGACTTCAA-CCTTACG-3′，下游引物：5′-GGTGACAAGTGAA-GCACAGA-3′。预期扩增的基因片段约为810 bp。1.4 ORF3基因的扩增取一无菌离心管，加入冷冻保存备用的病毒液100 μL，按总RNA提取试剂盒说明书步骤提取RNA，用1.3的下游引物作为反转录的引物，将RNA反转录为cD

    西北农林科技大学学报（自然科学版） 2015年2期2015-02-21

  • 大黄鱼cyclin B 1和cdc 2 cDNA序列特征及组织表达分析
    en－Bank登录号FJ195327），如图1.其中，编码区（ORF）长度为1 194bp，可编码397个氨基酸的蛋白.5′－非翻译区（UTR）长度为63bp；3′－UTR的长度为580bp（去除poly A），含有2个加尾信号（AUUAAA），和4个多聚腺苷酸化元件（cytoplasmic polyadenylation elements，简称为 CPEs；A／UUUUUAU／A）.推导的LC－CB1蛋白预测分子质量约为44.56ku，等电点约为8.76

    厦门大学学报（自然科学版） 2014年1期2014-12-01

  • 星星草PtGAPDH基因的克隆与表达分析
    eneBank登录号GW405820)，设计2条3′RACE上游引物GSP3′1和GSP3′2，然后以RACE cDNA库为模板进行巢式PCR扩增。第一轮PCR反应引物采用GSP3′1及AP1，反应程序为94℃ 2 min；94℃ 30 s，68℃ 30 s，72℃ 2 min，35个循环；72℃，7 min。第二轮PCR反应引物采用GSP3′2及AP2，反应程序为94℃ 2 min；94℃ 30 s，57℃ 30 s，72℃ 1.5 min，35个循环；

    草业学报 2014年2期2014-11-07

  • 斑点叉尾源维氏气单胞菌对四环素类抗生素的耐药性及耐药基因的检测
    GenBank登录号: 51492513)中的tetA基因, 大肠杆菌O69 (Escherichia coli serotype O69)质粒介导的tetA基因(GeneBank登录号: 227434002)、大肠杆菌Q19中的tetA基因(GeneBank登录号: 393195318)、肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)pKPI-6质粒(GenBank登录号:394557614)中的tetA基因、蜡样芽胞杆菌(Bacillus

    水生生物学报 2014年2期2014-11-05

  • 泰勒焦虫表面抗原TaSP、spag-1和Tams1基因片段克隆与序列分析
    源性最高的虫株登录号分别为FJ895154和AF214797的泰勒焦虫株，同源性分别高达100%与99.69%；与spag-1基因片段同源性最高的虫株登录号为X78188、XM949884和M63017，它们之间同源性为100%。泰勒焦虫；TaSP；spag-1；Tams1；克隆；序列分析泰勒焦虫病是蜱传性血液原虫病。泰勒焦虫（Thei1eria annu1ata，T.annu1ata）表面抗原有子孢子表面抗原 （The sporozoite antige

    草食家畜 2014年2期2014-06-05

  • 四种隐孢子虫半胱氨酸蛋白酶Cryptopain-1基因的克隆和序列分析
    及其前体序列（登录号：AF091366）；2004年，Abrahamsen等[15]通过对微小隐孢子虫Iowa Ⅱ分离株的全基因组序列进行测定，报道了微小隐孢子虫CP基因序列（GenBank登录号：XM_627814）；2009年，Na等[16]设计引物，以微小隐孢子虫DNA为模板成功扩增了该基因，将其标记为Cryptopain-1基因，并进行了克隆表达，采用免疫荧光技术对其在微小隐孢子虫子孢子上的定位进行了分析，发现Cryptopain-1在微小隐孢子虫

    中国动物传染病学报 2014年5期2014-04-13

  • 猪源附红细胞体rnpB基因的克隆与序列比较
    pB基因序列（登录号：EF523602）进行分析和比对，利用MEGA5.0软件构建系统发育树，并与16S rRNA判定结果进行比较。结果共得到42条猪附红细胞体rnpB基因和11条小附红细胞体（M. parvum）rnpB基因序列。猪附红细胞体上海分离株rnpB基因与GenBank登录的猪附红细胞体德国分离株rnpB基因之间的核苷酸序列相似性为98.1%～100.0%；小附红细胞体上海分离株rnpB基因与猪附红细胞体德国分离株rnpB基因序列的相似性为91

    中国动物传染病学报 2014年3期2014-04-13

  • 花生苹果酸脱氢酶基因的克隆及其蛋白序列分析
    Genbank登录号为KF499119，该基因编码区长度为1071bp，编码356个氨基酸。序列比对结果表明，AhMDH编码蛋白与大豆、蒺藜苜蓿和豌豆等具有较高的相似性。花生；苹果酸脱氢酶；克隆；序列分析0 引言苹果酸脱氢酶（malate dehydrogenase，MDH，EC 1.1.1.37），广泛存在于动、植物和微生物中，可以催化草酰乙酸与苹果酸之间的可逆转换。MDH可催化草酰乙酸生成苹果酸，使NAD+生成NADH，为硝酸还原过程提供还原力［1］；

    台州学院学报 2014年6期2014-02-24

  • 新疆巴州牦牛种群线粒体DNA遗传多样性及其系统发育分析
    GenBank登录号NC＿006853）设计引物用于Cyt b基因全序列扩增。上、下 游 引 物 分 别 为：P1 5′-CCATAAATAGGT GAAGGTTTGG-3＇和P2 5′-TTGATGGTGAGAC TGCAGTT-3′。引物委托上海生工生物工程有限公司合成。PCR扩增体系为50μL体积，包括10×Buffer 5μL，25mmol／L MgCl24μL，2.5 mmol／L d NTPs 4μL，10 pmol／μL 上、下游引物各1μL

    家畜生态学报 2013年8期2013-01-07

  • 黄鳝IRF-1和IRF-2保守序列的克隆与表达
    BI上的鳜 （登录号为 AY647431.1）、大黄鱼 （Larimichthyscrocea，登录号为GU175707.2）、斜带石斑鱼 （Epinepheluscoioides，登录号为 GU988700.1）和大西洋鲑 （Salmosalar，登录号为CBL58209.1）IRF-1cDNA序列的保守部分设计简并引物IRF-1-F1和IRF-1-R1，扩增黄鳝IRF-1cDNA的中间序列 （登录号为JN695589）（表1）；根据NCBI上的牙鲆 （

    长江大学学报(自科版) 2011年36期2011-04-08

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